林木遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位統(tǒng)計分析

內(nèi)容概要

本書包括緒論、上篇和下篇，首次較系統(tǒng)、詳細、全面地整理和介紹了近交群體（如回交群體、F2代群體等）的遺傳圖譜的構(gòu)建和QTL定位的統(tǒng)計分析模型以及相關(guān)的數(shù)學(xué)方法。同時，針對目前林木高密度分子遺傳圖譜的構(gòu)建和QTL精確定位的需要，著重研究了全同胞群體遺傳圖譜的構(gòu)建和 QTL定位的統(tǒng)計模型。本書緊扣遺傳圖譜構(gòu)建和QTL定位的前沿研究展開，結(jié)構(gòu)嚴密，理論性強，在內(nèi)容安排上考慮到了讀者使用的實用性和方便性。　　本書適合從事動植物育種的科技工作者、相關(guān)專業(yè)的本科高年級學(xué)生和研究生閱讀參考。

書籍目錄

前言緒論　0.1　林木遺傳圖譜構(gòu)建研究的現(xiàn)狀　0.2　QTL定位統(tǒng)計方法的研究進展　　0.2.1　數(shù)量遺傳學(xué)的發(fā)展歷史　　0.2.2　近交群體的QTL作圖方法　　0.2.3　異交群體的QTL作圖方法　　0.2.4　林木QTL作圖　　上篇　遺傳圖譜構(gòu)建的統(tǒng)計方法　第1章　背景知識和基本概念　　1.1　遺傳背景　　1.2　減數(shù)分裂　　1.3　重組、干擾和遺傳距離　　1.4　作圖函數(shù)　　1.5　實驗交配群體　　　1.5.1　回交群體　　　1.5.2　F2群體　　1.6　極大似然法與似然比檢驗　　1.7　EM算法　　1.8　皮爾遜卡方統(tǒng)計量　　1.9　顯著性檢驗　　1.10　分子標記數(shù)據(jù)和表型數(shù)據(jù)　第2章　兩點連鎖分析　　2.1　位點的分離檢驗　　　2.1.1　單位點的分離檢驗　　　2.1.2　兩個位點的連鎖檢驗　　2.2　近交系兩點連鎖分析　　　2.2.1　回交群體　　　2.2.2　F2群體　　2.3　全同胞家系兩位點連鎖分析　　　2.3.1　全同胞家系標記分離特征　　　2.3.2　連鎖相推斷及重組率估計　第3章　多位點連鎖分析　　3.1　隱馬爾可夫模型　　　3.1.1　觀測數(shù)據(jù)的概率　　　3.1.2　重建隱狀態(tài)　　　3.1.3　參數(shù)估計　　3.2　回交群體數(shù)據(jù)　　3.3　F2群體數(shù)據(jù)　　3.4　全同胞數(shù)據(jù)　第4章　連鎖群劃分和基因位點排序　　4.1　連鎖群的劃分　　4.2　三位點排序　　4.3　多位點排序　　　4.3.1　多位點排序的目標函數(shù)　　　4.3.2　多位點排序的計算方法　　4.4　模擬構(gòu)建全同胞群體的遺傳連鎖圖譜　　4.5　杉木遺傳圖譜的構(gòu)建下篇　QTL定位的統(tǒng)計方法　第5章　QTL單標記分析　　5.1　回交群體的單標記分析　　　5.1.1　t檢驗　　　5.1.2　方差分析　　　5.1.3　線性回歸模型　　　5.1.4　極大似然法　　5.2　F2群體的單標記分析　　　5.2.1　t檢驗　　　5.2.2　方差分析　　　5.2.3　回歸分析　　　5.2.4　極大似然法　第6章　QTL區(qū)間作圖法　　6.1　QTL基因型的條件概率　　6.2　極大似然法　　　6.2.1　回交群體　　　6.2.2　R代群體　　6.3　線性回歸法　　　6.3.1　回交群體　　　6.3.2　R代群體　第7章　復(fù)合區(qū)間作圖　　7.1　理論基礎(chǔ)　　7.2　回交群體作圖　　7.3　F2群體作圖　第8章　異交群體的QTL作圖　　8.1　半同胞群體QTL作圖　　　8.1.1　ANOVA方法　　　8.1.2　極大似然法　　8.2　全同胞群體QTL作圖　　8.3　MCMC作圖　　　8.3.1　Gibbs抽樣　　　8.3.2　Metropolis-Hastings方法　　　8.3.3　MCMC方法作圖　　8.4　林木F1代群體的QTL作圖　　　8.4.1　區(qū)間作圖和復(fù)合區(qū)問作圖　　　8.4.2　杉木F1代群體的QTL作圖　　　8.4.3　討論主要參考文獻附錄A　全同胞遺傳連鎖圖譜構(gòu)建軟件FsLinkageMap1.0使用說明　A1　數(shù)據(jù)格式　A2　數(shù)據(jù)分析　A3　遺傳連鎖圖譜的繪制

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