常用生物數(shù)據(jù)分析軟件

內(nèi)容概要

　　本書較為系統(tǒng)全面地介紹了生物信息學(xué)分析各個方面的軟件用法，結(jié)合光盤具體實例，方便使用。全書共分8章，內(nèi)容包括：Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹，介紹了基本的Unix/Linux操作命令；數(shù)據(jù)的基本處理，介紹了如何處理常用的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)；序列的比對，介紹了常用比對軟件的用法及其在應(yīng)用過程中要注意的問題；基因組/基因的注釋，介紹了Coding和Non-Codoing基因的預(yù)測方法；SNP分析，介紹了常用的從生物學(xué)數(shù)據(jù)中尋找SNP的軟件；進化分析專題，介紹了幾種分子進化分析軟件，內(nèi)容涉及進化樹的構(gòu)建、Ka/Ks的計算等；基因表達分析專題，介紹了EST及生物芯片分析的流程和方法；蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測，介紹了蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測的流程及方法?！　”緯m合于生物信息學(xué)專業(yè)本科生及研究生使用。

書籍目錄

序前言第1章　Unix/Linux操作系統(tǒng)介紹1.1　遠程登錄1.2　文件的復(fù)制、刪除和移動命令1.3　目錄的創(chuàng)建、刪除及更改目錄命令1.4　文本查看命令1.5　文本處理命令1.6　改變文件或目錄的權(quán)限命令1.7　備份與壓縮命令1.8　磁盤及系統(tǒng)管理1.9　軟件安裝簡介1.10　其他第2章　數(shù)據(jù)的基本處理2.1　數(shù)據(jù)常用格式介紹2.2　測序原理介紹2.3　華圖轉(zhuǎn)化（Phred）2.4　文件轉(zhuǎn)換（phd2fasta）2.5　載體屏蔽（cross_match）2.6　序列聚類拼接2.7　Consed2.8　引物設(shè)計（Primer3）主要參考文獻第3章　序列的比對3.1　全局比對3.2　局部比對主要參考文獻第4章　基因組/基因的注釋4.1　重復(fù)序列分析4.2　RNA分析4.3　基因預(yù)測4.4　基因功能注釋主要參考文獻第5章　SNP分析5.1　Polyphred5.2　SNPdetector5.3　cross_match主要參考文獻第6章　進化分析專題6.1　Phylip6.2　Paml6.3　KaKs_Calculator6.4　FGF6.5　MEGA主要參考文獻第7章　基因表達分析專題7.1　EST表達序列標(biāo)簽分析7.2　生物芯片分析7.3　Motif預(yù)測主要參考文獻第8章　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測8.1　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)知識介紹8.2　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法8.3　蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的Threading方法8.4　蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)預(yù)測流程介紹主要參考文獻

編輯推薦

　　《常用生物數(shù)據(jù)分析軟件》從實際使用的具體分析工具入手，對信息分析的幾個主要方面進行了最為細致的講解，包括軟件的安裝、輸入輸出數(shù)據(jù)的格式說明、常用參數(shù)的選取等，并配以實例數(shù)據(jù)方便大家熟悉及使用。《常用生物數(shù)據(jù)分析軟件》還附贈光盤，其中的每個軟件都對應(yīng)于相應(yīng)的目錄。該書可供各大專院校作為教材使用，也可供從事相關(guān)工作的人員作為參考用書使用。

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