蛋白質(zhì)相互作用及亞細(xì)胞定位原理與技術(shù)

內(nèi)容概要

本書(shū)匯總了具有多年生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室工作經(jīng)驗(yàn)的研究人員在蛋白質(zhì)相互作用研究方面的經(jīng)驗(yàn)和心得體會(huì)，同時(shí)注重吸收借鑒了國(guó)際上相關(guān)領(lǐng)域最新的進(jìn)展。     本書(shū)從蛋白質(zhì)相互作用的基本理論開(kāi)始，到各種經(jīng)典的蛋白質(zhì)相互作用的鑒定技術(shù)，再到生物信息學(xué)的應(yīng)用，內(nèi)容涵蓋了當(dāng)前國(guó)際上蛋白質(zhì)相互作用研究領(lǐng)域的各個(gè)方面。書(shū)中每個(gè)章節(jié)的基本內(nèi)容都包括：引言、原理、實(shí)驗(yàn)材料、詳細(xì)步驟、結(jié)果分析(實(shí)例)、注意要點(diǎn)、疑難分析解答、參考文獻(xiàn)。本書(shū)編者力求做到深入淺出，讓書(shū)稿對(duì)實(shí)驗(yàn)具有實(shí)際指導(dǎo)意義。本書(shū)的出版能對(duì)國(guó)內(nèi)的研究人員在蛋白質(zhì)功能研究方面做出有益的指導(dǎo)。

書(shū)籍目錄

第一部分  蛋白質(zhì)相互作用概論  第一章  蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)  第二章  蛋白質(zhì)相互作用的定量分析第二部分  實(shí)驗(yàn)方法  第三章  酵母雙雜交系統(tǒng)篩選和驗(yàn)證蛋白質(zhì)相互作用  第四章  細(xì)菌雙雜交技術(shù)  第五章  哺乳動(dòng)物雙雜交  第六章  噬菌體展示技術(shù)  第七章  GST沉降實(shí)驗(yàn)  第八章  免疫共沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)  第九章  Far-Westem blotting實(shí)驗(yàn)  第十章  蛋白質(zhì)化學(xué)交聯(lián)  第十一章  串聯(lián)親和純化  第十二章  雙向凝膠電泳分析蛋白質(zhì)復(fù)合物  第十三章  用于質(zhì)譜分析的凝膠分離相互作用蛋白質(zhì)的樣品準(zhǔn)備  第十四章  激光共聚焦技術(shù)在蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位與蛋白質(zhì)相互作用中的應(yīng)用第三部分  生物信息學(xué)在蛋白質(zhì)相互作用研究中的應(yīng)用  第十五章  利用計(jì)算生物學(xué)的方法進(jìn)行全基因組水平的蛋白質(zhì)相互作用分析  第十六章  蛋白質(zhì)相互作用生物信息學(xué)檢索與預(yù)測(cè)  第十七章  常用互聯(lián)網(wǎng)蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)資源的使用

章節(jié)摘錄

　　一、引言　　隨著基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)時(shí)代的到來(lái)以及對(duì)大分子的研究不斷深入，我們開(kāi)始更深入地解釋和揭示生命的奧秘。研究人員可以通過(guò)實(shí)驗(yàn)手段得到幾種類(lèi)型蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)模式，蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)的研究表明蛋白質(zhì)相互作用存在著很大的復(fù)雜性和多變性。與此相襯，蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)解析的手段在某些方面已經(jīng)不能滿(mǎn)足要求，現(xiàn)在研究的發(fā)展需要對(duì)成批量的蛋白質(zhì)，特別是對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合體相互之間的作用模式進(jìn)行結(jié)晶和結(jié)構(gòu)的解析。以前，蛋白質(zhì)復(fù)合物的三維結(jié)構(gòu)僅限于抗原抗體復(fù)合物的結(jié)構(gòu)，以及蛋白酶和抑制劑復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)，對(duì)于在生物體內(nèi)更復(fù)雜的信號(hào)分子傳導(dǎo)途徑中的蛋白質(zhì)的相互作用以及它們的晶體結(jié)構(gòu)則研究相對(duì)較少。隨著近年來(lái)研究的深入，對(duì)這方面開(kāi)始有一些初步的研究。目前，結(jié)構(gòu)研究比較普遍的有兩類(lèi)蛋白質(zhì)復(fù)合物，一類(lèi)是結(jié)構(gòu)域－結(jié)構(gòu)域復(fù)合物（domain－domain），即兩個(gè)預(yù)先折疊好的結(jié)構(gòu)域相互作用形成個(gè)復(fù)合物；另一類(lèi)是結(jié)構(gòu)域－蛋白質(zhì)復(fù)合物（domain-protein），這類(lèi)復(fù)合物中的一個(gè)組分在游離的狀態(tài)下是線(xiàn)性分子?！　∪藗冴P(guān)于蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)的了解，一方面來(lái)自通過(guò)實(shí)驗(yàn)手段對(duì)這些復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)進(jìn)行解析，明確其相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)；另一方面則來(lái)自于理論上的計(jì)算和推測(cè)，通過(guò)對(duì)多數(shù)蛋白質(zhì)的疏水性、可接近的蛋白質(zhì)表面大小、形狀以及氨基酸殘基特性等結(jié)構(gòu)特點(diǎn)，對(duì)蛋白質(zhì)復(fù)合物組分的內(nèi)部、表面和相互作用的界面這些結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行分析總結(jié)，推論相互作用蛋白質(zhì)表面的一些規(guī)律性的特征，并試圖通過(guò)蛋白質(zhì)的疏水性去推測(cè)它們相互作用的位點(diǎn)?！　”菊聦目傮w水乎上對(duì)蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)進(jìn)行概括性的闡述，從結(jié)構(gòu)上對(duì)其相互作用的機(jī)制進(jìn)行探討。

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