蛋白質(zhì)相互作用及亞細胞定位原理與技術

內(nèi)容概要

本書匯總了具有多年生物學實驗室工作經(jīng)驗的研究人員在蛋白質(zhì)相互作用研究方面的經(jīng)驗和心得體會，同時注重吸收借鑒了國際上相關領域最新的進展。     本書從蛋白質(zhì)相互作用的基本理論開始，到各種經(jīng)典的蛋白質(zhì)相互作用的鑒定技術，再到生物信息學的應用，內(nèi)容涵蓋了當前國際上蛋白質(zhì)相互作用研究領域的各個方面。書中每個章節(jié)的基本內(nèi)容都包括：引言、原理、實驗材料、詳細步驟、結(jié)果分析(實例)、注意要點、疑難分析解答、參考文獻。本書編者力求做到深入淺出，讓書稿對實驗具有實際指導意義。本書的出版能對國內(nèi)的研究人員在蛋白質(zhì)功能研究方面做出有益的指導。

書籍目錄

第一部分  蛋白質(zhì)相互作用概論  第一章  蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構基礎  第二章  蛋白質(zhì)相互作用的定量分析第二部分  實驗方法  第三章  酵母雙雜交系統(tǒng)篩選和驗證蛋白質(zhì)相互作用  第四章  細菌雙雜交技術  第五章  哺乳動物雙雜交  第六章  噬菌體展示技術  第七章  GST沉降實驗  第八章  免疫共沉淀(Co-IP)實驗  第九章  Far-Westem blotting實驗  第十章  蛋白質(zhì)化學交聯(lián)  第十一章  串聯(lián)親和純化  第十二章  雙向凝膠電泳分析蛋白質(zhì)復合物  第十三章  用于質(zhì)譜分析的凝膠分離相互作用蛋白質(zhì)的樣品準備  第十四章  激光共聚焦技術在蛋白質(zhì)亞細胞定位與蛋白質(zhì)相互作用中的應用第三部分  生物信息學在蛋白質(zhì)相互作用研究中的應用  第十五章  利用計算生物學的方法進行全基因組水平的蛋白質(zhì)相互作用分析  第十六章  蛋白質(zhì)相互作用生物信息學檢索與預測  第十七章  常用互聯(lián)網(wǎng)蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫資源的使用

章節(jié)摘錄

　　一、引言　　隨著基因組學、蛋白質(zhì)組學時代的到來以及對大分子的研究不斷深入，我們開始更深入地解釋和揭示生命的奧秘。研究人員可以通過實驗手段得到幾種類型蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構模式，蛋白質(zhì)晶體結(jié)構的研究表明蛋白質(zhì)相互作用存在著很大的復雜性和多變性。與此相襯，蛋白質(zhì)結(jié)構解析的手段在某些方面已經(jīng)不能滿足要求，現(xiàn)在研究的發(fā)展需要對成批量的蛋白質(zhì)，特別是對蛋白質(zhì)復合體相互之間的作用模式進行結(jié)晶和結(jié)構的解析。以前，蛋白質(zhì)復合物的三維結(jié)構僅限于抗原抗體復合物的結(jié)構，以及蛋白酶和抑制劑復合物的晶體結(jié)構，對于在生物體內(nèi)更復雜的信號分子傳導途徑中的蛋白質(zhì)的相互作用以及它們的晶體結(jié)構則研究相對較少。隨著近年來研究的深入，對這方面開始有一些初步的研究。目前，結(jié)構研究比較普遍的有兩類蛋白質(zhì)復合物，一類是結(jié)構域－結(jié)構域復合物（domain－domain），即兩個預先折疊好的結(jié)構域相互作用形成個復合物；另一類是結(jié)構域－蛋白質(zhì)復合物（domain-protein），這類復合物中的一個組分在游離的狀態(tài)下是線性分子?！　∪藗冴P于蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用結(jié)構基礎的了解，一方面來自通過實驗手段對這些復合物晶體結(jié)構進行解析，明確其相互作用的結(jié)構基礎；另一方面則來自于理論上的計算和推測，通過對多數(shù)蛋白質(zhì)的疏水性、可接近的蛋白質(zhì)表面大小、形狀以及氨基酸殘基特性等結(jié)構特點，對蛋白質(zhì)復合物組分的內(nèi)部、表面和相互作用的界面這些結(jié)構特征進行分析總結(jié)，推論相互作用蛋白質(zhì)表面的一些規(guī)律性的特征，并試圖通過蛋白質(zhì)的疏水性去推測它們相互作用的位點?！　”菊聦目傮w水乎上對蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)相互作用的結(jié)構基礎進行概括性的闡述，從結(jié)構上對其相互作用的機制進行探討。

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