分子生物學(xué)軟件應(yīng)用

內(nèi)容概要

本書共包括四個部分。第一部分介紹了計算機(jī)軟件在核酸序列分析中的應(yīng)用，主要包括序列格式轉(zhuǎn)換、結(jié)構(gòu)功能分析、克隆與引物設(shè)計等；第二部分介紹了計算機(jī)軟件在蛋白質(zhì)序列分析中的應(yīng)用，主要包括理化性質(zhì)分析、結(jié)構(gòu)預(yù)測、三維分子顯示等；第三部分介紹了計算機(jī)軟件在序列比對中的應(yīng)用，包括BLAST、本地BLAST、多序列兩兩比對與進(jìn)化樹分析等；第四部分介紹了計算機(jī)軟件在文獻(xiàn)管理與引用中的應(yīng)用，主要包括文獻(xiàn)管理、參考文獻(xiàn)的引用等。本書主要面向生物、醫(yī)學(xué)專業(yè)的研究生、高年級本科生，以及相關(guān)專業(yè)的其他研究人員。

書籍目錄

第一部分 核酸序列分析　1 序列檢索與格式轉(zhuǎn)換　　1.1 序列檢索　　1.2 序列格式簡介　　1.3 格式轉(zhuǎn)換　2 一級結(jié)構(gòu)分析　　2.1 組成成分分析　　2.2 重復(fù)序列　　2.3 序列變換　3 克隆　　3.1 酶切位點查找　　3.2 模擬電泳　　3.3 電泳圖像分析　　3.4 質(zhì)粒繪圖　　3.5 克隆策略與過程顯示　4 引物設(shè)計　　4.1 引物設(shè)計的基本原則　　4.2 引物設(shè)計與分析　　4.3 高通量引物與探針設(shè)計　5 測序拼裝　　5.1 測序圖分析　　5.2 測序拼裝　6 DNA功能分析　　6.1 ORF查找與翻譯　　6.2 Motif查找　7 RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測　　7.1 RNAstructure　　7.2 RNAdraw　　7.3 DNAstar 第二部分 蛋白質(zhì)序列分析  1 理化性質(zhì)分析    1.1 蛋白酶酶切特性　　1.2 滴定曲線與等電點　　1.3 親水性和疏水性　　1.4 電荷密度　2 二級結(jié)構(gòu)預(yù)測　　2.1 DNAstar 　　2.2 Vector NTI Advance　　2.3 ANTHEPROT　3 其他特殊局部結(jié)構(gòu)分析　　3.1 膜蛋白的跨膜螺旋　　3.2 信號肽　　3.3 卷曲螺旋　　3.4 抗原決定簇　4 三維分子顯示　　4.1 RasMol　　4.2 Vector NTI Advance　　4.3 Cn3D第三部分 序列比對及進(jìn)化樹　1 BLAST　　1.1 BLAST簡介　　1.2 BLAST、實踐　　1.3 BLAST、高級選項　2 本地BLAKI　3 多序列之間的兩兩比對與進(jìn)化樹分析　　3.1 C1ustalX　　3.2 DNAstar 　　3.3 Vector NTI Advance　　3.4 PLYLIP 第四部分 文獻(xiàn)管理與引用　1 文獻(xiàn)管理　　1.1 Reference Manager　　1.2 EndINote 　　1.3 NoteExpress　　1.4全文查找　2 在Word中引用文獻(xiàn)　　2.1 Reference Manager　　2.2 EndNote 　　2.3 NoteExpress附錄1 軟件簡介附錄2 參考文獻(xiàn)

編輯推薦

　　《分子生物學(xué)軟件應(yīng)用》主要面向生物、醫(yī)學(xué)專業(yè)的研究生、高年級本科生，以及相關(guān)專業(yè)的其他研究人員。

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