計算機(jī)輔助分子生物學(xué)實驗設(shè)計與分析

內(nèi)容概要

　　《計算機(jī)輔助分子生物學(xué)實驗設(shè)計與分析》為生物醫(yī)學(xué)實驗技術(shù)系列叢書分冊之一。全書包含5篇共26章和4個附錄，內(nèi)容涉及PCR實驗設(shè)計、RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測、核酶設(shè)計、反義核酸設(shè)計、siRNA設(shè)計、pBV220載體中外源基因高效表達(dá)設(shè)計、pPIC9載體中外源基因高效表達(dá)設(shè)計、B細(xì)胞抗原表位預(yù)測、T細(xì)胞抗原表位預(yù)測、蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測與顯示、蛋白質(zhì)功能位點分析、寡核苷酸芯片探針設(shè)計、基于基因表達(dá)譜的差異基因識別、基于基因表達(dá)譜的樣本分類、基于基因表達(dá)譜的樣本聚類、利用Perl和Bioperl進(jìn)行生物信息學(xué)分析和利用MatLab進(jìn)行生物信息學(xué)分析等，對加快實驗進(jìn)程和提高實驗的成功率具有一定幫助。　　可作為分子生物學(xué)實驗技術(shù)人員的參考書，也可作為在校生物醫(yī)學(xué)類本科生與研究生的入門參考書。

書籍目錄

第一篇　生物信息學(xué)基礎(chǔ)第1章　生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫簡介第2章　生物信息學(xué)軟件簡介第3章　序列比較與進(jìn)化樹構(gòu)建第二篇　核酸序列分析第4章　DNA序列翻譯為蛋白質(zhì)序列第5章　限制性酶切位點分析第6章　轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點預(yù)測第7章　啟動子預(yù)測第8章　PCR實驗設(shè)計第9章　RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測第10章　核酶設(shè)計第11章　反義核酸設(shè)計第12章　siRNA設(shè)計第13章　大腸桿菌系統(tǒng)pBV220載體中外源基因高效表達(dá)設(shè)計第14章　酵母系統(tǒng)pPIC9載體中外源基因高效表達(dá)設(shè)計第三篇　蛋白質(zhì)序列分析第15章　蛋白質(zhì)基本性質(zhì)分析第16章　蛋白質(zhì)跨膜區(qū)預(yù)測第17章　蛋白質(zhì)信號肽預(yù)測第18章　B細(xì)胞抗原表位預(yù)測第19章　T細(xì)胞抗原表位預(yù)測第20章　蛋白質(zhì)功能位點分析第21章　蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測第22章　蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預(yù)測與顯示第四篇　基因表達(dá)譜分析第23章　寡核苷酸芯片探針設(shè)計第24章　基于基因表達(dá)譜的差異基因識別．第25章　基于基因表達(dá)譜的樣本分類第26章　基于基因表達(dá)譜的樣本聚類第五篇　附錄附錄1　利用Perl和Bioperl進(jìn)行生物信息學(xué)分析附錄2　利用MatLab進(jìn)行生物信息學(xué)分析附錄3　BioSun軟件介紹附錄4　相關(guān)網(wǎng)址列表結(jié)束語

章節(jié)摘錄

　　第2章　生物信息學(xué)軟件簡介　　1　概論　　隨著多種類型的海量生物信息數(shù)據(jù)的產(chǎn)生，從中挖掘生物信息和提取知識，并基于這些知識解決生物學(xué)問題的一門新興學(xué)科——生物信息學(xué)／計算生物學(xué)應(yīng)運而生，其中，以解決生物學(xué)問題（理論與實驗兩個方面）為生物信息學(xué)／計算生物學(xué)的靈魂所在。事實上，對生物醫(yī)學(xué)工作者來說，他們主要關(guān)心的事是如何利用生物信息學(xué)的方法和軟件工具來分析他們在研究中產(chǎn)生的實驗數(shù)據(jù)和從中提取有生物學(xué)意義的信息，為進(jìn)一步的研究提供幫助，或?qū)嶒炦M(jìn)行輔助設(shè)計以增加實驗的預(yù)見性。因此，開展分子生物學(xué)實驗輔助設(shè)計的理論研究和軟件設(shè)計具有重要意義，可以促進(jìn)生物醫(yī)學(xué)研究逐漸從定性階段走向定量階段，進(jìn)而加快實驗進(jìn)程和提高分子生物學(xué)研究的效率，使生物信息學(xué)成為生物醫(yī)學(xué)工作者的得力助手，對生物醫(yī)學(xué)研究具有一定的推動作用?！　?　生物信息學(xué)軟件分類　　隨著生物數(shù)據(jù)規(guī)模的不斷增長，對數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析的難度不斷加大，生物醫(yī)學(xué)研究者越來越依賴于生物信息學(xué)軟件及相關(guān)的服務(wù)平臺來進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。目前，主要有下列三種形式的軟件工具可供利用?！　　?/pre>








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