出版時間:2011-4 出版社:大連理工大學 作者:《新世紀應用型高等教材化工類課程規(guī)劃教材·計算機輔助藥物設計:基本方法原理概要與實踐詳解》編寫組 頁數(shù):216 字數(shù):325000
內(nèi)容概要
本書系作者在近年來為同濟大學本科生開設的“計算機輔助藥物設計”課程所用講義基礎上,經(jīng)擴展、補充和修改編寫而成。
本書內(nèi)容涵蓋了“計算機輔助藥物設計”七大研究方向———虛擬小分子生成、大分子結構預測、定量構效關系、藥效團模型、分子對接、全新藥物設計和動態(tài)模擬(分子動
力學/隨機動力學/蒙特卡洛),并且第一次系統(tǒng)地對這些技術的操作進行了講解。本書共有九章,第一章對“計算機輔助藥物設計”和配合本書實例講解的國際著名軟件MOE的全貌進行了介紹;第二章到第八章依次對“計算機輔助藥物設計”的七大研究方向進行了理論和實踐操作的系統(tǒng)介紹;第九章對MOE中三個特色模塊進行了單獨介紹。另外,每章還設有一個“知識拓展”,該部分主要是介紹一些更為前沿或熱門的知識,希望能為讀者的相關研究或深入學習起到拋磚引玉的效果。
另外,為方便使用,凡本書中提及的輸入文件、中間結果和最后結果等附件,讀者均可到www.cadd-moe.org網(wǎng)站中按章節(jié)免費獲取。
本書是國內(nèi)第一本專門為本科生撰寫的《計算機輔助藥物設計》教材,此外,本書也將是工業(yè)界相關人員和研究生的一本非常合適的參考書。
作者簡介
朱瑞新博士任教于同濟大學生命科學與技術學院。其主要科研方向有:
書籍目錄
第一章 “計算機輔助藥物設計”與MOE概貌
一、導言
二、“計算機輔助藥物設計”概貌
三、MOE概貌
四、知識拓展
五、本章小結
六、復習思考題
第二章 虛擬組合庫設計
一、虛擬組合庫設計的運用
二、組合化學與虛擬組合庫設計
三、虛擬組合庫設計方法原理
四、虛擬組合庫設計的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第三章 生物大分子結構預測
一、生物大分子結構預測的運用
二、生物大分子結構測定與生物大分子結構預測
三、生物大分子結構預測的方法原理
四、同源模建的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第四章 定量構效關系
一、定量構效關系的運用
二、構效關系與定量構效關系
三、定量構效關系的方法原理
四、定量構效關系的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第五章 藥效團模型
一、藥效團模型的運用
二、活性特征基團和藥效團
三、藥效團模型的方法原理
四、藥效團模型的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第六章 分子對接
一、分子對接的運用
二、分子(生化)水平的高通量篩選技術和分子對接
三、分子對接的方法原理
四、分子對接的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第七章 全新藥物設計
一、全新藥物設計的運用
二、片段組學(基于片段的藥物設計)和全新藥物設計
三、全新藥物設計的方法原理
四、全新藥物設計的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第八章 分子動力學、隨機動力學和蒙特卡洛
一、分子動力學、隨機動力學和蒙特卡洛的運用
二、體系全部性質(zhì)測定和分子動力學/隨機動力學/蒙特卡洛
三、分子動力學、隨機動力學和蒙特卡洛的方法原理
四、分子動力學、隨機動力學和蒙特卡洛的操作要領
五、知識拓展
六、本章小結
七、復習思考題
第九章 MOE中其他實用模塊
一、蛋白 -配體相互作用指紋
二、大分子質(zhì)子化
三、抗體同源模建
四、知識拓展
五、本章小結
六、復習思考題
參考文獻
圖書封面
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