未培養(yǎng)微生物

內(nèi)容概要

自然界中存在的微生物物種數(shù)量可能以數(shù)百萬計(jì)，但以純培養(yǎng)物得以分離并加以描述的僅有幾千種。造成這一巨大差異的主要原因是超過99％的所有環(huán)境微生物令人感到迷惑地?zé)o法在實(shí)驗(yàn)室中生長(zhǎng)。微生物不可培養(yǎng)性這一現(xiàn)象披認(rèn)為是基礎(chǔ)和應(yīng)用微生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)主要挑戰(zhàn)，找到一種可以觸及大部分未培養(yǎng)微生物的方法可能會(huì)改變今天我們所知道的生物學(xué)和生物技術(shù)的許多方面。
Slava
S．Epstein教授編著的《未培養(yǎng)微生物(精)》描述了這一現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)、目前對(duì)未培養(yǎng)微生物生理和分子本質(zhì)的假設(shè)、最新“智取”未培養(yǎng)微生物的方法以及大多數(shù)未培養(yǎng)微生物在醫(yī)學(xué)和生物技術(shù)的重要性?！段磁囵B(yǎng)微生物(精)》揭示了未培養(yǎng)微生物的隱藏世界、它們無與倫比的多樣性和巨大的應(yīng)用潛力。

書籍目錄

未培養(yǎng)微生物多樣性的統(tǒng)計(jì)性估測(cè)
1引言
2豐度數(shù)據(jù)
2.1參數(shù)豐度模型
2.2非參數(shù)豐度模型
2.3基于覆蓋度的估計(jì)
2.4討論
3發(fā)生率數(shù)據(jù)
3.1參數(shù)發(fā)生率模型
3.2發(fā)生率非參數(shù)模型
3.3基于覆蓋度的發(fā)生率非參數(shù)模型
3.4含有協(xié)變量的模型
4評(píng)論
附錄：軟件
參考文獻(xiàn)
大規(guī)模平行測(cè)序表征?生物種群結(jié)構(gòu)
1微生物多樣性和可棲息性
2對(duì)微生物分類學(xué)和生態(tài)學(xué)的分子影響
3大量平行DNA焦磷酸測(cè)序和微生物多樣性
4rRNA高可變區(qū)焦磷酸序列的生物信息學(xué)解釋
5微生物多樣性和“稀有生物圈”的拓展性展望
6大規(guī)模平行DNA測(cè)序和微生物種群結(jié)構(gòu)的未來調(diào)查
參考文獻(xiàn)
用微陣列技術(shù)檢測(cè)和鑒定未培養(yǎng)微生物
1引言
2微芯片的類型
2.1系統(tǒng)發(fā)育寡核苷酸芯片(POAs)
2.3群落基因組芯片
2.4宏基因組芯片
2.5全基因組開放閱讀框芯片
2.6同位素芯片
2.7其他類型的芯片
3微芯片的應(yīng)用
3.1微生物檢測(cè)
3.2微生物種群動(dòng)力學(xué)和活性
3.3微生物鑒定
4芯片分析所面臨的挑戰(zhàn)及其局限性
4.1依賴于已培養(yǎng)生物和／或已知序列的分析
4.2芯片分析的靈敏度
4.3特異性
4.4芯片的定量性
4.5數(shù)據(jù)分析和標(biāo)準(zhǔn)化
5結(jié)束語(yǔ)
參考文獻(xiàn)
天然實(shí)驗(yàn)室：來自未培養(yǎng)甲烷營(yíng)養(yǎng)菌的經(jīng)驗(yàn)
1引言
2厭氧嗜甲烷菌的發(fā)現(xiàn)
3海底厭氧嗜甲烷菌的鑒定及定量
4從原位觀測(cè)到體外富集
4.1尋找AOM熱點(diǎn)
4.2能量限制：甲烷及硫酸鹽的供應(yīng)及終產(chǎn)物的移除
4.3最適溫度與pH
4.4避氧
4.5其他生長(zhǎng)需求
4.6ANME與伴生菌富集的抑制或解偶聯(lián)
5展望：其他分離技術(shù)
參考文獻(xiàn)
不可培養(yǎng)微生物的單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增
1引言
2細(xì)胞分離方法
2.1微液滴捕獲法
2.2技術(shù)
2.3熒光激活細(xì)胞分類技術(shù)(FACS)
2.4微流控術(shù)
3單個(gè)細(xì)胞的DNA分離和擴(kuò)增
4測(cè)序和基因組裝配
5從基因組學(xué)到生物學(xué)
參考文獻(xiàn)
生長(zhǎng)緩慢異養(yǎng)微生物的生理生態(tài)適應(yīng)性及培養(yǎng)的結(jié)果
1引言
2資源和營(yíng)養(yǎng)限制的生長(zhǎng)
2.1生物量水平的營(yíng)養(yǎng)限制
2.2生長(zhǎng)速率的營(yíng)養(yǎng)限制
3對(duì)營(yíng)養(yǎng)限制的生理適應(yīng)
4效率 Vs.快速生長(zhǎng)
5生長(zhǎng)緩慢作為增加可培養(yǎng)能力的一項(xiàng)策略
6為什么有大平板計(jì)數(shù)異常(GPCA)？
7總結(jié)
參考文獻(xiàn)
可育但不可培養(yǎng)細(xì)菌
1引言
2霍亂弧菌和其他物種的可育但不可培養(yǎng)狀態(tài)
3VBNC細(xì)胞的計(jì)數(shù)方法
4霍亂暴發(fā)模型
參考文獻(xiàn)
微生物不可培養(yǎng)性的普適性模型
1引言
2不可培養(yǎng)微生物的原位培養(yǎng)
2.1方法一：擴(kuò)散室(Diffusion
Chamber)
2.2方法二：分離芯片(Ichip)
3不可培養(yǎng)微生物的體外生長(zhǎng)及其馴化
3.1獲得不可培養(yǎng)物種的可培養(yǎng)變種
3.2微生物的共生生長(zhǎng)和共培養(yǎng)
4不可培養(yǎng)機(jī)制：MSC33的個(gè)案研究
5微生物的種群中的異質(zhì)性
6對(duì)大平板計(jì)數(shù)異?，F(xiàn)象的解釋
6.1模型
6.2模型對(duì)不可培養(yǎng)現(xiàn)象及更多現(xiàn)象的解釋
6.3探索者模型的含義
7結(jié)論
參考文獻(xiàn)
未培養(yǎng)微生物的宏基因組和新抗生素發(fā)現(xiàn)
1次級(jí)代謝物與抗生素
1.1次級(jí)代謝物介紹
1.2新抗生素將來自于何處？
1.3微生物多樣性和宏基因組學(xué)
2以土壤DNA用于藥物發(fā)現(xiàn)的早期宏基因組實(shí)驗(yàn)
2.1hsp70、gyrA、纖維素酶及其他
2.2eDNA文庫(kù)和異源表達(dá)
2.3信號(hào)、抗性、Turbomycins和Terragines
3從eDNA中克隆次級(jí)代謝生物合成途徑的進(jìn)展.
3.1次級(jí)代謝物途徑集約模型
3.2“制約”宏基因組
3.3更好的載體
3.4更好的宿主
3.5文庫(kù)的大小
3.6最新篩選
4結(jié)論
參考文獻(xiàn)
耐受性菌株、生物被膜和可培養(yǎng)性問題
1耐受性細(xì)胞的發(fā)現(xiàn)
2生物被膜與耐受性菌株的復(fù)蘇
參考文獻(xiàn)
把概念推向極限：不可培養(yǎng)細(xì)菌與太空生物學(xué)
1微生物培養(yǎng)
2表型生長(zhǎng)
3生命指征
4無生長(zhǎng)發(fā)生時(shí)的生命檢測(cè)
5生命的動(dòng)力學(xué)指征
6地球以外樣品中尋找生命
7不可培養(yǎng)的外星生命
8有關(guān)生命起源及生命的早期進(jìn)化的建議：思考素材
參考文獻(xiàn)
譯者后記

圖書封面

評(píng)論、評(píng)分、閱讀與下載

---

    未培養(yǎng)微生物 PDF格式下載

---