免疫信息學(xué)原理及其應(yīng)用

內(nèi)容概要

　　《免疫信息學(xué)原理及其應(yīng)用》內(nèi)容包括免疫生物學(xué)基礎(chǔ)、免疫系統(tǒng)功能模建、免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)挖掘、B細(xì)胞表位的預(yù)測、T細(xì)胞表位的預(yù)測、抗原處理與TAP轉(zhuǎn)運(yùn)預(yù)測、感染性疾病的傳播動(dòng)力學(xué)及免疫流行病學(xué)模型、抗病毒疫苗研發(fā)、反向疫苗學(xué)在細(xì)菌疫苗中的應(yīng)用、免疫信息學(xué)在抗原蟲病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用、抗蠕蟲疫苗研發(fā)、免疫信息學(xué)和抗腫瘤疫苗的研發(fā)、生物信息學(xué)在抗自身免疫病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用、免疫信息學(xué)在實(shí)驗(yàn)與臨床免疫學(xué)中的應(yīng)用。

書籍目錄

第1章　緒論　1.1　免疫信息學(xué)是一門新興交叉學(xué)科　1.2　免疫信息學(xué)研究的基本問題　1.3　免疫信息學(xué)研究的基本方法　　1.3.1 數(shù)據(jù)庫構(gòu)建方法　　1.3.2　計(jì)算與統(tǒng)計(jì)學(xué)方法　　1.3.3　數(shù)學(xué)建模與計(jì)算機(jī)模擬方法　1.4　免疫信息學(xué)的應(yīng)用　　1.4.1 系統(tǒng)免疫學(xué)理論與人工智能研究　　1.4.2　疫苗研發(fā)與傳染病研究　　1.4.3 實(shí)驗(yàn)與臨床免疫學(xué)研究　參考文獻(xiàn)第2章　免疫生物學(xué)基礎(chǔ) 　2.1　免疫應(yīng)答　　2.1.1 天然免疫　　2.1.2　適應(yīng)性免疫　2.2　免疫系統(tǒng)的組成與結(jié)構(gòu)　　2.2.1 免疫器官 　2.2.2 免疫細(xì)胞　　2.2.3 免疫分子　2.3　免疫系統(tǒng)的機(jī)制　　2.3.1 抗原　　2.3.2 免疫系統(tǒng)的特異性識別　　2.3.3 免疫記憶與免疫耐受　2.4　免疫監(jiān)督　2.5　免疫效應(yīng)及其調(diào)節(jié)機(jī)制　　2.5.1 免疫效應(yīng)　　2.5.2 免疫調(diào)節(jié)　2.6　免疫系統(tǒng)的復(fù)雜性特征　　2.6.1 復(fù)雜性適應(yīng)系統(tǒng)　　2.6.2 免疫系統(tǒng)的自組織　　2.6.3 免疫系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)　2.7　小結(jié)　參考文獻(xiàn)第3章　免疫系統(tǒng)功能模建 　3.1　淋巴細(xì)胞的免疫識別與增殖動(dòng)力學(xué)　　3.1.1 T、B淋巴細(xì)胞受體庫大小估計(jì) 　　3.1.2　淋巴細(xì)胞增殖與分化的克隆模型　3.2　獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫應(yīng)答　　3.2.1 獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫記憶　　3.2.2　獨(dú)特型網(wǎng)絡(luò)與免疫耐受　3.3　免疫系統(tǒng)的調(diào)節(jié)　　3.3.1 免疫相關(guān)細(xì)胞的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)　　3.3.2 免疫應(yīng)答的細(xì)胞調(diào)節(jié)　　3.3.3 宿主免疫應(yīng)答的系統(tǒng)水平的調(diào)節(jié)　3.4　小結(jié)　參考文獻(xiàn)第4章　免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫和數(shù)據(jù)挖掘 　4.1　數(shù)據(jù)庫概念　4.2　免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫　　4.2.1 簡介　　4.2.2　基于網(wǎng)絡(luò)的免疫信息學(xué)公共數(shù)據(jù)庫利用　　4.2.3　免疫多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(IPD)　　4.2.4 SYFPEITHI 　　4.2.5 IMTECH免疫信息學(xué)數(shù)據(jù)庫 　　4.2.6 抗原決定簇?cái)?shù)據(jù)庫(IEDB)　4.3　數(shù)據(jù)挖掘與知識發(fā)現(xiàn)　　4.3.1 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學(xué)中的作用　　4.3.2 數(shù)據(jù)挖掘在免疫信息學(xué)中的應(yīng)用步驟　　4.3.3 短肽預(yù)測的數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵗⒖嘉墨I(xiàn)第5章　B細(xì)胞表位的預(yù)測第6章　T細(xì)胞表位的預(yù)測第7章　抗原處理與TAP轉(zhuǎn)運(yùn)預(yù)測第8章　感染性疾病的傳播動(dòng)力學(xué)及免疫流行病學(xué)模型　第9章　抗病毒疫苗研究第10章　反向疫苗學(xué)在抗細(xì)菌疫苗中的應(yīng)用第11章　免疫信息學(xué)在抗原蟲病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用第12章　抗蠕蟲疫苗研發(fā)第13章　免疫信息學(xué)和抗腫瘤疫苗的研發(fā)第14章　生物信息學(xué)在抗自身免疫病疫苗研發(fā)中的應(yīng)用第15章　免疫信息學(xué)在實(shí)驗(yàn)與臨床免疫學(xué)中的應(yīng)用附錄A附錄B

章節(jié)摘錄

第1章　緒論1.1　免疫信息學(xué)是一門新興交叉學(xué)科免疫信息學(xué)（immunoinformatics．）是建立在現(xiàn)代免疫學(xué)和信息學(xué)基礎(chǔ)上的一門新的交叉學(xué)科，是運(yùn)用信息學(xué)的理論和方法解決免疫學(xué)及疫苗學(xué)問題的學(xué)科，也是研究免疫系統(tǒng)調(diào)控和免疫應(yīng)答過程中信息傳遞規(guī)律的科學(xué)。immunoinformatics一詞由以色列魏茨曼研究所的已故著名的應(yīng)用數(shù)學(xué)家、數(shù)學(xué)生物學(xué)家和理論免疫學(xué)家Lee A．Segel于2001年提出，最初用來描述免疫系統(tǒng)中由細(xì)胞信號分子如細(xì)胞因子、趨化因子等介導(dǎo)的調(diào)控作用機(jī)制，其中的信息學(xué)含義與信號發(fā)送與傳遞等性質(zhì)相似。此后，一些生物信息學(xué)者、疫苗學(xué)者以及免疫學(xué)者對免疫信息學(xué)概念的內(nèi)涵和外延進(jìn)行了拓展，并被人們所接受。嚴(yán)格說來，要給免疫信息學(xué)一個(gè)非常具體的學(xué)科界定和教科書式的闡釋是比較困難的，這主要是由于免疫信息學(xué)與相關(guān)的一些新興學(xué)科有著密切的聯(lián)系。我們知道，20世紀(jì)90年代以來，由于多學(xué)科理論與技術(shù)（如高通量測序及生物芯片等技術(shù)）的進(jìn)展與突破，各種組學(xué)（如基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)等）蓬勃發(fā)展，給科學(xué)界提供了海量的生物學(xué)基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。人們相信這些通過還原論方法和技術(shù)（以分子生物學(xué)技術(shù)為主流）獲得的生物學(xué)數(shù)據(jù)深刻而又復(fù)雜，必須采用綜合論方法與技術(shù)對其進(jìn)行闡釋；而綜合論方法則是以信息論方法為基礎(chǔ)的，它利用信息技術(shù)分析大量的生物數(shù)據(jù)，從中發(fā)掘出生物學(xué)的一般原理，并試圖通過各個(gè)生物組成部分的研究推導(dǎo)出系統(tǒng)行為?！?/pre>




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《免疫信息學(xué)原理及其應(yīng)用》由馮新港主編。





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