E-mail訪問網(wǎng)絡生物醫(yī)學資源實用指南

內(nèi)容概要

本書是一本介紹如何通過E-mail獲取Internet上醫(yī)學和生物學信息資源的基本原理和方法的工具書。 包括的內(nèi)容有：檢索Medline--蛋白質(zhì)、核酸與三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫；檢索分析與人類基因組研究相關(guān)的一些重要的網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫，如序列的同源性、開放閱讀框架(ORF)預測、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析、RNA二級結(jié)構(gòu)預測、分子模建等，這些都是生命科學最前沿的研究熱點?，F(xiàn)代科學研究的一個顯著特點就是綜合性大研究，學科之間交叉、聯(lián)系日益緊密。本書介紹了如何通過Internet上郵件列表和新聞組這兩種形式在世界范圍內(nèi)與同行或非同行交流、聯(lián)系、協(xié)作、探討；如何訪問WWW上的醫(yī)學生物學資源和WWW的各類檢索引擎；如何訪問FTP資源，尋找和下載有用的一些生物學檔案資料；附錄介紹一些使用E-mail技巧，使各章介紹的方法事半功倍。    本書的主要讀者對象為醫(yī)學、藥學和生命科學等領(lǐng)域的大學生、研究生、醫(yī)務工作者、教師和研究人員。

書籍目錄

緒論第一章  Medline——蛋白質(zhì)、核酸與三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫檢索  第一節(jié) 簡介  第二節(jié) Entrez可檢索的數(shù)據(jù)庫  第三節(jié) 詞條檢索    一 字段說明符    二 字段解釋    三 布爾檢索    四 截詞檢索    五 范圍檢索  第四節(jié) 搜索參數(shù)選項    一 顯示方式選項    二 其他選項  第五節(jié) 替代符號  第六節(jié) 流水號檢索    一 GenBank登錄號與序列標識符    二 用于UID中的Fasta格式第二章  基因和基因組序列分析  第一節(jié) NCBI BLAST電子郵件服務器的介紹    一 訪問NCBI BLAST電子郵件服務器    二 BLAST電子郵件檢索請求示例    三 NCBI BLAST電子郵件服務器檢索的可選程序    四 NCBI BLAST電子郵件服務器可用數(shù)據(jù)庫    五 NCBI BLAST電子郵件服務器指令表    六 利用NCBI BLAST電子郵件服務器檢索的序列格式    七 序列標識符    八 檢索請求的呈遞與等候    九 向GenBank呈遞新的數(shù)據(jù)或更新修訂  第二節(jié) BLAST程序使用詳解    一 BLAST程序算法    二 BLAST序列對比分值方案    三 鄰域    四 HSP分值閾    五 Karlin-Altschul統(tǒng)計學    六 SUM統(tǒng)計學和Poisson統(tǒng)計學    七 P值、比對分值及信息    八 匹配報告中的選擇度    九 搜索敏感度    十 遺傳代碼    十一 設(shè)置參數(shù)    十二 控制輸出    十三 環(huán)境變量    十四 支持功能    十五 輸出示例與詳解    十六 原因不明的故障  第三節(jié) BLAST常見問題解答    一 最常見的問題    二 BLAST程序    三 查詢格式    ……第三章  訪問醫(yī)學與生物學郵件列表第四章  訪問醫(yī)學與生物學新聞組第五章  訪問醫(yī)學與生物學WWW資源第六章  通過E-maill訪問WWW的各類檢索引擎第七章  訪問醫(yī)學與生物學FTP資源附錄 一些實用的 E-mail技巧

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