出版時(shí)間:2006-10 出版社:化學(xué)工業(yè)出版社 作者:理查德J.辛普森 頁(yè)數(shù):843 譯者:何大澄
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內(nèi)容概要
以蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)的分析策略為核心,本書的主要內(nèi)容包括:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的背景知識(shí) ;蛋白質(zhì)樣品制備和分析的各種實(shí)驗(yàn)方法,從傳統(tǒng)的化學(xué)分析,到經(jīng)典的色譜、質(zhì)譜技術(shù),直至最新的蛋白質(zhì)芯片和信息學(xué)方法;上述各種技術(shù)方法的原理、應(yīng)用,以及相關(guān)的支持性信息和參考資料。 針對(duì)蛋白質(zhì)不同的研究目的(如樣品制備、結(jié)構(gòu)測(cè)序或功能研究),每一章盡可能完全地羅列了各種實(shí)驗(yàn)方案,可供不同規(guī)模實(shí)驗(yàn)室的研究者選擇應(yīng)用。在介紹每一個(gè)實(shí)驗(yàn)方案時(shí),以“step—by—step”操作指南的形式逐步展開(kāi),詳細(xì)列出實(shí)驗(yàn)儀器、試劑及操作步驟,并針對(duì)常見(jiàn)問(wèn)題給出經(jīng)驗(yàn)性的提示或解決方案。 毫無(wú)疑問(wèn),對(duì)于蛋白質(zhì)化學(xué)、生物化學(xué)的研究人員在蛋白質(zhì)組學(xué)這一新興領(lǐng)域?qū)で笞钚碌募夹g(shù)方法,本書是一部必備的實(shí)驗(yàn)指南。而對(duì)于遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、分子生物學(xué)研究人員開(kāi)展表型和細(xì)胞功能研究,以及醫(yī)學(xué)和生物工程領(lǐng)域開(kāi)展蛋白質(zhì)相關(guān)研究,本書也是基本的實(shí)驗(yàn)工具書。
書籍目錄
第1章 蛋白質(zhì)組學(xué)導(dǎo)論 1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)定義 1.2 為何除基因組學(xué)外還要有蛋白質(zhì)組學(xué)? 1.3 蛋白質(zhì)的鑒定和分析 1.4 差異顯示蛋白質(zhì)組學(xué)(比較蛋白質(zhì)組學(xué)) 1.5 翻譯后修飾 1.6 蛋白質(zhì)微陣列 1.7 捕獲分子和靶分子 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第2章 單向聚丙烯酰胺凝膠電泳 2.1 聚丙烯酰胺凝膠電泳的基本原理 2.2 SDS用于變性的聚丙烯酰胺凝膠 2.3 乙酸-尿素 PAGE根據(jù)蛋白質(zhì)的大小和電荷分離蛋白質(zhì) 2.4 三羥甲基甘氨酸 SDS-PAGE分離小分子多肽 2.5 非變性PAGE(自然凝膠電泳)分離天然蛋白和蛋白復(fù)合體 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第3章 細(xì)胞和亞細(xì)胞提取物的制備 3.1 通過(guò)機(jī)械或化學(xué)方法破碎組織及細(xì)胞 3.2 通過(guò)變性和復(fù)性從包含體中回收重組蛋白 3.3 富含目的蛋白的亞細(xì)胞提取物的制備 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 選讀文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第4章 固相化pH梯度雙向凝膠電泳 4.1 雙向凝膠電泳樣品的制備 4.2 第一向:固相pH梯度等電聚焦電泳 4.3 第二向:根據(jù)分子量分離蛋白質(zhì) 4.4 雙向凝膠的染色 4.5 雙向凝膠中蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)移 4.6 雙向凝膠圖像的獲取和分析 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn)第5章 反相高效液相色譜 5.1 RP-HPLC基于疏水相互作用分離分子 5.2 RP-HPLC標(biāo)準(zhǔn)色譜條件 5.3 微柱反相色譜——適合蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 選讀文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第6章 蛋白質(zhì)氨基端及羧基端序列分析 6.1 Edman降解法對(duì)多肽進(jìn)行氨基端測(cè)序 6.2 限制序列分析速度的幾個(gè)環(huán)節(jié) 6.3 應(yīng)用HPLC和PAGE制備微量測(cè)序樣品 6.4 不能進(jìn)行測(cè)序的蛋白質(zhì)需去封閉 6.5 磷酸化位點(diǎn)的微量測(cè)序分析有助于繪制信號(hào)途徑 6.6 固相測(cè)序儀是回收磷酸化氨基酸的最好方法 6.7 其他氨基端反應(yīng)法 6.8 羧基端測(cè)序方法存在的問(wèn)題 6.9 自動(dòng)化羧基端測(cè)序 6.10 高靈敏度高效率的羧基端分析 6.11 氨基端和羧基端序列組合分析 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 選讀文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第7章 電泳分離的蛋白質(zhì)肽譜和序列分析 7.1 制備肽譜的微量方法和大規(guī)模方法 7.2 消除蛋白質(zhì)分子內(nèi)部的共價(jià)交聯(lián)以提高肽譜質(zhì)量 7.3 酶法和化學(xué)法裂解多肽鏈 7.4 基于SDS-PAGE的肽譜制備方法(Cleveland法) 7.5 肽譜用于確定蛋白質(zhì)中的二硫鍵 7.6 應(yīng)用RP-HPLC制備肽譜 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 選讀文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第8章 質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用 8.1 基本原理 8.2 現(xiàn)代離子化方法:離子如何形成 8.3 串聯(lián)質(zhì)譜儀 8.4 串聯(lián)質(zhì)譜儀的質(zhì)量分析器結(jié)構(gòu) 8.5 質(zhì)譜與蛋白質(zhì)分離方法聯(lián)用進(jìn)行蛋白質(zhì)混合物的分離和分析 8.6 體內(nèi)及體外標(biāo)記方法:質(zhì)譜用于定量和表達(dá)蛋白質(zhì)組學(xué) 8.7 利用MS數(shù)據(jù)鑒定蛋白質(zhì)的搜索引擎 8.8 總結(jié) 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第9章 用蛋白質(zhì)組學(xué)方法繪制磷酸化位點(diǎn)圖譜 9.1 完整磷酸化蛋白的檢測(cè)和分析 9.2 通過(guò)蛋白質(zhì)的裂解獲得磷酸化蛋白多肽 9.3 用MS或MS/MS來(lái)確定磷酸化蛋白的特性 9.4 用MS/MS對(duì)磷酸化多肽進(jìn)行測(cè)序 9.5 對(duì)磷酸化蛋白特征進(jìn)行分析的多維策略 9.6 用于磷酸化多肽序列分析的MS和MS/MS技術(shù)的出現(xiàn) 9.7 總結(jié) 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第10章 蛋白質(zhì)復(fù)合體性質(zhì)的研究 10.1 mRNA的選擇性剪接對(duì)蛋白質(zhì)產(chǎn)物活性的特定影響 10.2 用相互作用組描述生理復(fù)合體 10.3 利用酵母雙雜交分析與蛋白質(zhì)組學(xué)方法研究蛋白質(zhì)間相互作用 10.4 用親和捕獲技術(shù)分析蛋白質(zhì)相互作用 10.5 了解多蛋白質(zhì)復(fù)合體的結(jié)構(gòu) 10.6 FRET分析體內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用 10.7 通過(guò)測(cè)定結(jié)合常數(shù)來(lái)分析蛋白質(zhì)間相互作用 10.8 蛋白質(zhì)微陣列促進(jìn)大規(guī)模的蛋白質(zhì)研究 實(shí)驗(yàn)方案 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源第11章 蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的詮釋:利用生物信息學(xué)發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)、功能及其相互作用 11.1 基因及其同源體的識(shí)別 11.2 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能 11.3 蛋白質(zhì)在通路中的定位和蛋白質(zhì)細(xì)胞功能的識(shí)別 參考文獻(xiàn) 網(wǎng)絡(luò)資源附錄1 參考圖表附錄2 技術(shù)附錄3 注意事項(xiàng)附錄4 供應(yīng)商索引
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蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)指南 PDF格式下載