分子模擬與計算機輔助藥物設計

內容概要

這本《分子模擬與計算機輔助藥物設計(精)》由魏冬青、顧若需、連鵬、張濤、王瑩編著?；诮y(tǒng)計力學的分子模擬算法是連接經(jīng)典或量子分子模型與生物化學實驗觀察測量的橋梁之一。計算機輔助藥物設計就是利用已知配體一受體作用的生物化學信息和對其物理化學特性的認識，在計算機輔助下研究和優(yōu)化新配體(假定中候選藥物分子)的過程?！斗肿幽M與計算機輔助藥物設計(精)》詳細介紹了分子模擬的數(shù)學、生物學、物理和化學基礎，分子模擬的算法，蛋白質結構的模擬，藥物設計的基本方法和信息系統(tǒng)等內容，并列舉了不少藥物設計的實例。本書可作為高等院校相關專業(yè)教材，也可作為相關領域研究人員的參考書。

書籍目錄

第1章  分子模擬的數(shù)學基礎
  1.1 級數(shù)
  1.2 積分的概念和方法
第2章  分子模擬的生物信息學基礎
  2.1 序列比對
  2.2 序列分析
  2.3 蛋白質結構預測
  2.4 基因芯片技術
  2.5 各種數(shù)據(jù)庫和網(wǎng)絡資源
  參考文獻
第3章  分子模擬的物理和化學基礎
  3.1 量子化學計算的基本原理
  3.2 密度泛函理論(DeityFunctionalTheory，DFT)
  3.3 原子間與分子間作用力
  3.4 分子力場
  3.5 幾種常見的分子力場
  3.6 溶劑介電質模型
  3.7 多體問題和有效成對勢能
  參考文獻
第4章  分子模擬基本算法
  4.1 統(tǒng)計力學基礎
  4.2 MonteCarlo模擬
  4.3 分子模擬
  4.4 從頭算分子動力學(A6.[nitioMolectllarI)ynamics，AIMI))簡介
  4.5 QM/MM簡介
  4.6 能量優(yōu)化算法與過渡態(tài)求解
  參考文獻
第5章  蛋白質結構模擬
  5.1 蛋白質結構的預測
  5.2 反相折疊方法
  5.3 從頭折疊法
  5.4 常用的網(wǎng)站
  5.5 常用軟件
  參考文獻
第6章  藥物設計的基本方法
  6.1 早期的探索
  6.2 二維定量構效關系
  6.3 三維定量構效關系
  6.4 更高維定量構效關系
  6.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析方法
第7章  藥物設計的信息系統(tǒng)
  7.1 化學信息系統(tǒng)
  7.2 組合化學信息管理系統(tǒng)
  7.3 生物信息數(shù)據(jù)庫和軟件
  7.4 數(shù)據(jù)庫搜索技術
  參考文獻
第8章  計算機輔助藥物設計應用實例
  8.1 抗SARS的藥物設計
  8.2 HIV蛋白酶抑制劑的篩選
  8.3 流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的研究
  8.4 定量構效關系與嗯唑烷酮抗菌藥物的設計
  8.5 抗老年癡呆癥的藥物篩選
  參考文獻

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