化學(xué)信息學(xué)

前言

化學(xué)信息學(xué)是一門化學(xué)、化工與信息科學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)交叉的新興學(xué)科，它采用信息學(xué)方法來解決化學(xué)問題。由于計(jì)算機(jī)和網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)廣泛應(yīng)用到各個(gè)化學(xué)研究領(lǐng)域，許多化學(xué)研究學(xué)科都與化學(xué)信息密切關(guān)聯(lián)。大量的傳統(tǒng)學(xué)科與信息科學(xué)結(jié)合發(fā)展成為新興的邊沿學(xué)科，共同構(gòu)成了信息化社會(huì)的基礎(chǔ)。近年來，借助于計(jì)算機(jī)和網(wǎng)絡(luò)技術(shù)，在化學(xué)實(shí)驗(yàn)中使用大量的新儀器和新方法，從而得到了大量的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。信息的急劇膨脹與人們有限的學(xué)習(xí)時(shí)間及吸收能力形成了巨大的矛盾，反過來又要求使用計(jì)算機(jī)和網(wǎng)絡(luò)技術(shù)對海量信息進(jìn)行高速和精確的處理和利用，對化學(xué)信息處理提出更高和更迫切的要求，以達(dá)到產(chǎn)生和處理的相對平衡?；瘜W(xué)信息的收集、處理、管理和利用，必不可少地要借助信息學(xué)的方法和技術(shù)。于是，化學(xué)信息學(xué)隨著計(jì)算機(jī)在化學(xué)中的廣泛應(yīng)用和化學(xué)信息網(wǎng)絡(luò)化的不斷發(fā)展而引起化學(xué)家的廣泛關(guān)注和高度重視。今天，化學(xué)信息學(xué)已經(jīng)成為藥物和生命科學(xué)研究不可缺少的熱門工具。正由于人們認(rèn)識到化學(xué)信息學(xué)對于現(xiàn)代化學(xué)研究的重要性，近年來國外部分大學(xué)正嘗試在化學(xué)教育中系統(tǒng)地增加化學(xué)信息學(xué)課程?；瘜W(xué)信息學(xué)的發(fā)展將推動(dòng)傳統(tǒng)的化學(xué)教育模式的改革。2003年德國的JohannGasteiger和ThomasEngel出版了“ChemoinformaticsATextbook”一書，該教科書系統(tǒng)、全面、深入淺出地介紹了化學(xué)信息學(xué)的各個(gè)研究領(lǐng)域，及其研究現(xiàn)狀和今后的發(fā)展動(dòng)向。2004年，梁逸曾等將該書翻譯成中文版，即《化學(xué)信息學(xué)教程》，由化學(xué)工業(yè)出版社出版。在國內(nèi)，化學(xué)信息學(xué)的教學(xué)已經(jīng)引起了高度重視，我國教育部化學(xué)類專業(yè)教學(xué)指導(dǎo)分委員會(huì)已將化學(xué)信息學(xué)列入高等學(xué)?；瘜W(xué)類專業(yè)的化學(xué)教學(xué)基本內(nèi)容。目前，已經(jīng)有多所大學(xué)都已開設(shè)化學(xué)信息學(xué)或相關(guān)的課程，并出版了數(shù)種化學(xué)信息學(xué)教材?；瘜W(xué)信息學(xué)作為一門新的教學(xué)課程，其課程的要求、內(nèi)容、教學(xué)方式和教材等是課程建設(shè)的一項(xiàng)新任務(wù)。國外化學(xué)信息學(xué)的教學(xué)側(cè)重于專業(yè)方向教學(xué)，交叉性強(qiáng)，涵蓋廣。在國內(nèi)，化學(xué)信息學(xué)作為化學(xué)系各專業(yè)方向的必修課程之一，由于課時(shí)的限制，其教學(xué)內(nèi)容多側(cè)重于化學(xué)文獻(xiàn)學(xué)，其他的相關(guān)內(nèi)容多分別歸屬于另外的課程，并已經(jīng)另有專著出版。本書以化學(xué)信息資源檢索和化學(xué)結(jié)構(gòu)信息可視化為重點(diǎn)，強(qiáng)調(diào)現(xiàn)代數(shù)據(jù)庫檢索技術(shù)的使用，全面地介紹了數(shù)據(jù)庫檢索的基礎(chǔ)知識、常用文摘數(shù)據(jù)庫、常用全文數(shù)據(jù)庫、常用電子期刊、特種信息資源和常用化學(xué)事實(shí)數(shù)據(jù)庫等內(nèi)容。另外，本書重點(diǎn)介紹了化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化、分子模型的構(gòu)建及著名的分子圖形軟件的使用。為了教學(xué)的需要，本書也介紹了重要的印刷類化學(xué)文獻(xiàn)信息。

內(nèi)容概要

　　《化學(xué)信息學(xué)（第2版）》以化學(xué)信息資源檢索和化學(xué)結(jié)構(gòu)信息可視化為重點(diǎn)，強(qiáng)調(diào)現(xiàn)代數(shù)據(jù)庫檢索技術(shù)的使用，全面介紹了化學(xué)信息與數(shù)據(jù)庫檢索的基礎(chǔ)知識、常用文摘數(shù)據(jù)庫、常用全文數(shù)據(jù)庫、常用電子期刊、特種信息資源、常用化學(xué)事實(shí)數(shù)據(jù)庫及文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的管理等內(nèi)容。另外，《化學(xué)信息學(xué)（第2版）》重點(diǎn)介紹了化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化、分子模型的構(gòu)建及著名的分子圖形軟件的使用。為了教學(xué)需要，本書也介紹了重要的印刷類化學(xué)文獻(xiàn)信息?！　　痘瘜W(xué)信息學(xué)（第2版）》內(nèi)容新穎，實(shí)用性強(qiáng)，適用面廣，可作為高等院校有關(guān)專業(yè)本科生、研究生的教材，也可作為科學(xué)研究工作者、專業(yè)技術(shù)人員和圖書情報(bào)工作者了解掌握信息檢索與管理的學(xué)習(xí)參考。

書籍目錄

第一章  化學(xué)信息概論 1 第一節(jié)  化學(xué)信息與化學(xué)信息學(xué) 1一、化學(xué)信息學(xué)的產(chǎn)生和發(fā)展 1二、化學(xué)信息學(xué)的研究領(lǐng)域 2三、信息資源檢索的意義與作用 3四、化學(xué)信息學(xué)的課程內(nèi)容 4第二節(jié)  電子信息和數(shù)據(jù)庫 5一、電子信息 5二、數(shù)據(jù)庫 6三、在線化學(xué)數(shù)據(jù)庫 8第三節(jié)  信息檢索的方法和步驟 13一、信息檢索方法 13二、信息檢索效果的評價(jià) 14三、信息檢索技術(shù) 15四、信息檢索步驟 17 第二章  印刷類化學(xué)文獻(xiàn)信息 22 第一節(jié)  圖書分類法簡介 22一、圖書館的重要地位和作用 22二、圖書館圖書的分類系統(tǒng) 22第二節(jié)  重要工具書、專著和大全 24一、工具書 25二、專著和大全 27第三節(jié)  重要化學(xué)期刊簡介 29一、綜合性自然科學(xué)期刊 30二、化學(xué)學(xué)科綜合性期刊 30三、專業(yè)性化學(xué)期刊 31四、綜論類期刊 34第四節(jié)  化學(xué)文摘（Chemical Abstracts） 35一、CA類目 36二、文摘編排順序和格式 37三、文摘著錄內(nèi)容和格式 37四、CA中的索引 40五、CA檢索的注意事項(xiàng) 42 第三章  常用文摘數(shù)據(jù)庫 44 第一節(jié)  ISI數(shù)據(jù)庫 44一、ISI數(shù)據(jù)庫簡介 44二、科學(xué)引文索引（SCI） 45三、Web of Knowledge 46第二節(jié)  Current Contents數(shù)據(jù)庫 52一、數(shù)據(jù)庫簡介 52二、瀏覽文獻(xiàn) 52三、檢索文獻(xiàn) 55四、檢索結(jié)果及處理 58第三節(jié)  Web of Science 數(shù)據(jù)庫 61一、數(shù)據(jù)庫簡介 61二、數(shù)據(jù)庫檢索 62三、檢索結(jié)果及處理 66第四節(jié)  INSPEC數(shù)據(jù)庫 69一、數(shù)據(jù)庫簡介 69二、數(shù)據(jù)庫檢索 70第五節(jié)  BIOSIS Previews數(shù)據(jù)庫 72一、數(shù)據(jù)庫簡介 72二、數(shù)據(jù)庫檢索 72第六節(jié)  Chemical Abstract數(shù)據(jù)庫 74一、化學(xué)文摘社（CAS） 74二、CA網(wǎng)絡(luò)版（SciFinder Scholar）數(shù)據(jù)庫 76第七節(jié)  EI Village 2數(shù)據(jù)庫 85一、數(shù)據(jù)庫簡介 85二、數(shù)據(jù)庫檢索 85三、檢索結(jié)果及處理 88 第四章  常用全文數(shù)據(jù)庫 91 第一節(jié)  ProQuest數(shù)據(jù)庫 91一、數(shù)據(jù)庫簡介 91二、數(shù)據(jù)庫檢索 92三、檢索結(jié)果及處理 93第二節(jié)  EBSCO數(shù)據(jù)庫 94一、數(shù)據(jù)庫簡介 94二、數(shù)據(jù)庫檢索 95三、檢索結(jié)果及處理 97第三節(jié)  Science Direct數(shù)據(jù)庫 98一、數(shù)據(jù)庫簡介 98二、期刊/書籍瀏覽 99三、數(shù)據(jù)庫檢索 99四、檢索結(jié)果及處理 101第四節(jié)  中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 102一、數(shù)據(jù)庫簡介 102二、數(shù)據(jù)庫專欄目錄 102三、數(shù)據(jù)庫檢索 103四、檢索結(jié)果及處理 104第五節(jié)  萬方數(shù)據(jù)化期刊 106一、數(shù)據(jù)庫簡介 106二、數(shù)據(jù)庫檢索 106 第五章  常用電子期刊 109 第一節(jié)  SpringerLink 109一、概述 109二、瀏覽 109三、檢索方法 110四、檢索結(jié)果及處理 110第二節(jié)  Wiley InterScience 111一、概述 111二、瀏覽 112三、檢索方法 113四、檢索結(jié)果及處理 113第三節(jié)  Kluwer Online 116一、概述 116二、瀏覽 116三、檢索方法 117四、檢索結(jié)果及處理 118第四節(jié)  American Chemical Society 118一、概述 118二、瀏覽 119三、檢索方法 119四、檢索結(jié)果及處理 120第五節(jié)  Royal Society of Chemistry 121一、概述 121二、瀏覽 121三、檢索方法 122四、檢索結(jié)果及處理 122第六節(jié)  American Institute of Physics 122一、概述 122二、瀏覽 123三、檢索方法 123四、檢索結(jié)果及處理 124 第六章  特種信息資源 126 第一節(jié)  專利數(shù)據(jù)庫 126一、專利基礎(chǔ) 126二、中國專利數(shù)據(jù)庫 128三、美國專利數(shù)據(jù)庫 129四、歐洲專利數(shù)據(jù)庫 134五、專利搜索引擎——Google Patent（谷歌專利） 136第二節(jié)  會(huì)議文獻(xiàn)檢索（Proceedings） 138一、會(huì)議文獻(xiàn)概述 138二、會(huì)議錄引文索引（Conference Proceedings Citation Index） 138三、中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 139第三節(jié)  學(xué)位論文檢索 141一、PQDD博碩士學(xué)位論文數(shù)據(jù)庫 141二、CALIS學(xué)位論文庫 142三、中國博士學(xué)位論文和優(yōu)秀碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 143第四節(jié)  論文評價(jià)與引文索引檢索 144一、論文評價(jià) 144二、引文索引 144三、期刊引文報(bào)告（Journal Citation Reports） 145第五節(jié)  Reference Manager的使用 148一、RM簡介 148二、文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的導(dǎo)入 149三、RM的檢索 150四、RM與Word的結(jié)合使用 153第六節(jié)  EndNote的使用 155一、EndNote簡介 155二、EndNote文獻(xiàn)庫的操作 156三、EndNote文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的導(dǎo)入 158四、EndNote的在線檢索 159五、EndNote與Word的結(jié)合使用 161 第七章  常用化學(xué)事實(shí)數(shù)據(jù)庫 164 第一節(jié)  CrossFire Beilstein/Gmelin 的使用 164一、數(shù)據(jù)庫簡介 164二、檢索程序界面 165三、數(shù)據(jù)庫檢索 166四、檢索結(jié)果及處理 170五、應(yīng)用實(shí)例 171第二節(jié)  NIST Chemistry WebBook 176一、數(shù)據(jù)庫簡介 176二、數(shù)據(jù)庫檢索 177三、檢索結(jié)果及處理 178第三節(jié)  谷歌學(xué)術(shù)搜索（Google Scholar） 179一、概述 179二、檢索方法 180三、檢索結(jié)果 181第四節(jié)  科學(xué)搜索引擎（Scirus） 181一、概述 181二、檢索方法 182三、檢索結(jié)果及處理 184第五節(jié)  維基百科全書 185一、概述 185二、檢索方法 186三、檢索結(jié)果 186 第八章  化學(xué)結(jié)構(gòu)的可視化 187 第一節(jié)  化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化 187一、化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示 187二、二維化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化 188三、三維化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化 189四、大分子化學(xué)結(jié)構(gòu)的表示和可視化 191五、分子表面的顯示 192六、化學(xué)結(jié)構(gòu)的網(wǎng)絡(luò)表示 193第二節(jié)  ISIS/Draw 的使用 197一、簡介 197二、操作界面 197三、分子結(jié)構(gòu)圖的繪制 199四、電子轉(zhuǎn)移和原子特征的表示 200五、化學(xué)反應(yīng)式的繪制 201六、其他功能 201第三節(jié)  ChemDraw 的使用 202一、簡介 202二、操作界面 203三、二維分子結(jié)構(gòu)的繪制 206四、其他功能 210 第九章  三維分子模型設(shè)計(jì) 213 第一節(jié)  分子力學(xué)和分子建模 213一、分子力學(xué)基本原理 213二、分子力場參數(shù)化 216三、三維分子模型的構(gòu)建 217第二節(jié)  DS ViewerPro 的使用 218一、簡介 218二、操作界面 219三、分子模型的繪制 221四、分子模型的顯示 222五、其他功能 226第三節(jié)  Chem3D的使用 227一、簡介 227二、操作界面 228三、分子模型的操作 231四、分子模型的構(gòu)建 233五、分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的測定 236六、分子的計(jì)算 236七、分子表面和分子軌道圖形的顯示 237第四節(jié)  HyperChem的使用 238一、簡介 238二、工具欄的使用 239三、菜單命令 240四、使用實(shí)例 259第五節(jié)  GaussView的使用 261一、簡介 261二、操作界面 262三、分子模型的操作 265四、分子模型的構(gòu)建 267五、分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)的測定 270六、分子的計(jì)算 271七、計(jì)算結(jié)果的顯示 271 參考文獻(xiàn) 274

編輯推薦

《化學(xué)信息學(xué)(第2版)》內(nèi)容新穎，實(shí)用性強(qiáng)，適用面廣，可作為高等院校有關(guān)專業(yè)本科生、研究生的教材，也可作為科學(xué)研究工作者、專業(yè)技術(shù)人員和圖書情報(bào)工作者了解掌握信息檢索與管理的學(xué)習(xí)參考。

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