蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)精編

內(nèi)容概要

　　目前國際上蛋白質(zhì)組學(xué)研究蓬勃發(fā)展，而我國在中長期的規(guī)劃中也已經(jīng)明確加大投入力度。由于蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)具有成本高、周期長、步驟多、需要的知識面較寬等特點(diǎn)，所以對于實(shí)驗(yàn)人員的要求比較高?！　　兜鞍踪|(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)精編》不求學(xué)科方向、常規(guī)原理上的詳細(xì)講解，但求解決實(shí)際實(shí)驗(yàn)問題，以便大家能夠迅速上手開展實(shí)驗(yàn)并做好實(shí)驗(yàn)。體現(xiàn)了下列特色：　　深入探討蛋白質(zhì)組學(xué)研究中雙向凝膠電泳、質(zhì)譜、生物信息學(xué)與蛋白質(zhì)分析這三方面核心實(shí)驗(yàn)內(nèi)容；　　綜合多種實(shí)驗(yàn)的具體方案，探討不同實(shí)驗(yàn)方法之間的優(yōu)劣，以期使讀者能夠迅速在《蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)精編》中找到最適合、最簡便、最具體的實(shí)驗(yàn)操作方案；　　將蛋白質(zhì)組和質(zhì)譜研究中的約200個(gè)疑難問題進(jìn)行適當(dāng)?shù)慕馕?，結(jié)合詳細(xì)的操作步驟，幫助讀者“既會做也能明白”蛋白質(zhì)組研究?！　　兜鞍踪|(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù)精編》是專為蛋白質(zhì)組學(xué)工作者打造的一本實(shí)驗(yàn)手冊，可供相關(guān)領(lǐng)域的研究生、高年級本科生及其他研究人員參考閱讀。

書籍目錄

第1章 蛋白質(zhì)組學(xué)概論1.1 蛋白質(zhì)組學(xué)研究的背景1.2 蛋白質(zhì)組學(xué)的分類1.3 蛋白質(zhì)組學(xué)的主要應(yīng)用1.4 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究策略1.5 蛋白質(zhì)組技術(shù)的最新進(jìn)展1.5.1 定量蛋白質(zhì)組研究策略1.5.2 串聯(lián)多維分離策略1.5.3 蛋白質(zhì)磷酸化分析策略1.5.4 蛋白質(zhì)復(fù)合體分析策略1.5.5 細(xì)胞器蛋白質(zhì)組分析策略1.5.6 生物標(biāo)志物的質(zhì)譜驗(yàn)證策略1.6 發(fā)展趨勢參考文獻(xiàn)第2章 雙向電泳實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)與統(tǒng)計(jì)分析2.1 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法簡述2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)2.2.1 基本方法2.2.2 含區(qū)組因素的雙向電泳實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)2.2.3 如何合理進(jìn)行隨機(jī)化分組參考文獻(xiàn)第3章 雙向凝膠電泳3.1 樣品制備3.1.1 基本概念與原則3.1.2 實(shí)驗(yàn)方案范例3.1.3 常見問題與解析3.2 蛋白質(zhì)定量3.2.1 BCA法3.2.2 Bradford法3.3 第一向等電聚焦（IEF）3.3.1 IPG膠條、IPG緩沖液與水化液3.3.2 上樣3.3.3 常見問題3.4 第二向SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳3.4.1 SDS?PAGE凝膠的灌制3.4.2 膠條的平衡與轉(zhuǎn)移3.4.3 聚丙烯酰胺凝膠電泳3.4.4 常見問題3.5 凝膠的染色3.5.1 蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)中聚丙烯酰胺凝膠的考馬斯亮藍(lán)染色3.5.2 蛋白質(zhì)銀染色法3.5.3 二價(jià)鋅離子負(fù)染法3.5.4 糖蛋白的檢測3.6 轉(zhuǎn)印3.6.1 半干轉(zhuǎn)印3.6.2 垂直槽轉(zhuǎn)印3.6.3 麗春紅染色3.6.4 常見問題3.7 膠內(nèi)酶解3.7.1 實(shí)驗(yàn)步驟3.7.2 常見問題3.8 差異熒光表達(dá)分析系統(tǒng)3.8.1 實(shí)驗(yàn)步驟3.8.2 常見問題3.9 BlueNativePAGE電泳3.9.1 實(shí)驗(yàn)步驟3.9.2 常見問題參考文獻(xiàn)第4章 MALDI?TOF質(zhì)譜技術(shù)與問題解析4.1 MALDI?TOF質(zhì)譜簡介4.1.1 MALDI?TOF質(zhì)譜儀4.1.2 MALDI的基質(zhì)4.1.3 MALDI?TOF質(zhì)譜基本操作4.2 肽質(zhì)量指紋譜技術(shù)4.3 PSD或TOF/TOF肽序列標(biāo)簽技術(shù)4.4 臨床蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)4.4.1 原位蛋白質(zhì)組學(xué)4.4.2 液體蛋白質(zhì)芯片與血清多肽組學(xué)4.5 MALDI質(zhì)譜儀器的維護(hù)與注意事項(xiàng)4.5.1 日常儀器維護(hù)4.5.2 樣品檢測注意事項(xiàng)4.6 常見問題分析參考文獻(xiàn)第5章 納升電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)與問題解析5.1 電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜簡介5.1.1 電噴霧電離基本原理5.1.2 電噴霧質(zhì)譜的特點(diǎn)5.2 多肽測序與蛋白質(zhì)鑒定5.2.1 多肽測序5.2.2 蛋白質(zhì)鑒定5.3 無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究5.3.1 基本原理5.3.2 基于質(zhì)譜峰強(qiáng)度的定量方法的一般步驟5.3.3 應(yīng)用實(shí)例5.4 蛋白質(zhì)磷酸化分析5.4.1 前言5.4.2 磷酸化蛋白質(zhì)的分離和檢測5.4.3 磷酸肽的分離5.5 離子淌度質(zhì)譜及其應(yīng)用5.5.1 基本原理5.5.2 在蛋白質(zhì)組研究中的典型應(yīng)用5.5.3 展望5.6 多維色譜?串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)5.6.1 基于多維色譜分離的蛋白質(zhì)組研究基本原理5.6.2 主要應(yīng)用及需要解決的關(guān)鍵問題5.6.3 展望5.7 常規(guī)操作、儀器維護(hù)與注意事項(xiàng)5.7.1 Q?TOF質(zhì)譜儀的日常操作（Waters公司）5.7.2 Qstar（AB公司）5.7.3 BrukerHCT電噴霧質(zhì)譜儀的基本操作規(guī)程5.8 常見問題解析參考文獻(xiàn)第6章 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)分析技術(shù)6.1 生物信息學(xué)簡介6.2 蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫6.3 雙向電泳數(shù)據(jù)庫6.4 生物信息學(xué)網(wǎng)站與工具軟件6.5 MOWSE算法與結(jié)果評估6.6 蛋白質(zhì)鑒定與數(shù)據(jù)庫檢索方法（Mascot）6.6.1 Mascot檢索參數(shù)6.6.2 數(shù)據(jù)文件格式6.6.3 肽的裂解6.6.4 序列查詢6.6.5 查詢結(jié)果解析6.7 PMF與MS/MS數(shù)據(jù)組合查庫方法6.7.1 操作流程6.7.2 結(jié)果示例6.8 串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)搜庫結(jié)果質(zhì)量控制方法6.8.1 串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)搜庫結(jié)果質(zhì)量控制的研究現(xiàn)狀和問題6.8.2 結(jié)果數(shù)據(jù)集的質(zhì)量評價(jià)參數(shù)6.8.3 搜庫參數(shù)優(yōu)化6.8.4 展望6.9 Mascot的安裝與使用簡介6.10 常見問題解析參考文獻(xiàn)

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