應(yīng)用R軟件和Epicalc程序包分析流行病學(xué)數(shù)據(jù)

內(nèi)容概要

　　本書前4章介紹R軟件的概念和一些重要的基本元素，比如標(biāo)量、向量、矩陣、數(shù)組和數(shù)據(jù)框架的簡單處理方法。第5章介紹一些簡單的數(shù)據(jù)分析。第6章介紹日期和時間變量，并在第7章通過一些數(shù)據(jù)集來得到完全的詮釋，描述性統(tǒng)計量和行列表伴隨自動生成的圖形，使得重要的結(jié)果能得到更全面的展示。第8章通過行列表來觀察暴發(fā)，對各種類型的風(fēng)險評估比如風(fēng)險比率，可以用數(shù)字和圖形來顯示。第9章數(shù)據(jù)集的分析得到進(jìn)一步擴(kuò)展，處理不同水平間的聯(lián)系或0R值，并對如何分層作表，計算Mantel．Haenzsel的OR值，以及0R值的同質(zhì)性檢驗進(jìn)行了詳細(xì)的解釋，同時附以圖形說明。結(jié)合圖形，混雜這個概念能夠得以更好的理解。

書籍目錄

第1章　開始使用R軟件　安裝　Crimson編輯器  Tinn-R  開始使用R軟件  R的程序庫和程序包  Epicalc程序包  更新程序包  Rprofile．site  在線幫助  R作為計算器  R命令的語法  R對象  字符或字符串對象  在命令行中加入注釋  邏輯型：TRUE和FALSE  使用&（邏輯與）進(jìn)行邏輯連接  使用（邏輯或）進(jìn)行邏輯連接  TRUE和FALSE的值  參考文獻(xiàn)  練習(xí)第2章　向量　歷史記錄和對象保存  連接對象  系統(tǒng)數(shù)字向量  通過一個索引向量來得到子集向量  使用下標(biāo)向量選擇一個子集  與批處理向量有關(guān)的函數(shù)  非數(shù)值向量  對向量中的元素排序　從已有的向量創(chuàng)建一個因子變量　缺失值　練習(xí)第3章　數(shù)組、矩陣和表格  數(shù)組  將向量折疊起來放到數(shù)組中  使用下標(biāo)提取元素、行、列和子矩陣  向量捆綁  數(shù)組轉(zhuǎn)置  數(shù)組的基本統(tǒng)計分析  字符型數(shù)組  具有相同長度的兩個向量的隱含數(shù)組  矩陣  表格  表格和數(shù)組的歸納  列表  練習(xí)第4章　數(shù)據(jù)集  數(shù)組與數(shù)據(jù)框架的比較  從文本文件中獲取數(shù)據(jù)框架  數(shù)據(jù)錄入和分析  清空內(nèi)存和讀入數(shù)據(jù)  包含在Epicalc內(nèi)的數(shù)據(jù)框架  讀入數(shù)據(jù)  查看數(shù)據(jù)框架的內(nèi)容  歸納數(shù)據(jù)框架的特征  Codebook函數(shù)  從數(shù)據(jù)框架中抽取子集  在數(shù)據(jù)框架中添加一個變量  從數(shù)據(jù)框架中刪除變量  把數(shù)據(jù)框架調(diào)入搜索路徑  使用Epicalc中的“use”命令  “．data”與命令zap（）相抵觸  練習(xí)第5章　簡單數(shù)據(jù)探索  使用Epicalc進(jìn)行數(shù)據(jù)探索　……第6章　日期和時間第7章　暴發(fā)調(diào)查：時間的描述第8章　暴發(fā)調(diào)查：風(fēng)險評估第9章　優(yōu)勢比、混雜和交互作用第10章　基礎(chǔ)數(shù)據(jù)管理第11章　散點圖與線性回歸第12章　分層線性回歸第13章　曲線相關(guān)第14章　廣義線性模型第15章　Logistic回歸第16章　配對病例對照研究第17章　多項分類Logistic回歸第18章　有序分類Logistic回歸第19章　Poisson和負(fù)二項回歸第20章　多水平模型簡介第21章　生存分析第22章　Cox回歸第23章　樣本含量的估計第24章　文件第25章　處理大型數(shù)據(jù)集的策略第26章　處理有關(guān)態(tài)度方面的數(shù)據(jù)第27章　為撰寫論文準(zhǔn)備表格Epicalc函數(shù)Epicalc數(shù)據(jù)集練習(xí)參考答案

章節(jié)摘錄

　　第1章　開始使用R軟件　　本章主要討論第一次使用R軟件時的一些基本操作，包括安裝、數(shù)據(jù)錄入、文件輸出、命令文件的創(chuàng)建以及其他文檔操作。注意：本書是在Windows操作系統(tǒng)的基礎(chǔ)上寫的。　　安裝　　R軟件是在GNU公共使用權(quán)限術(shù)語下使用的，即R軟件是免費軟件。R軟件和Epicalc程序包的最新版本以及相關(guān)文件可以從CRAN（the Comprehensive R Archive Network）下載，該網(wǎng)址為：http：／／cran.r-project.or9／。世界范圍內(nèi)有很多R的鏡像儲存地址，使用者可以選取距離最近的地址進(jìn)行下載。　　R的安裝文件大約28MB。只要雙擊該文件并根據(jù)安裝提示就可以進(jìn)行安裝。安裝R后，R的快捷圖標(biāo)應(yīng)該出現(xiàn)在桌面上。右擊該圖標(biāo)可以修改R的啟動屬性，把缺省的開始文件夾替換為自己的工作文件夾，否則輸入和輸出文件將保存在程序文件夾下，這不是一種好的工作方式。用戶可以根據(jù)不同的研究課題為工作文件夾創(chuàng)建多個快捷圖標(biāo)。　　與本書有關(guān)的文件均儲存在“C：LRWorkplace”文件夾下。圖標(biāo)的屬性“Start in”的文本應(yīng)設(shè)為“C：＼IRWorkplace”（不要鍵入雙引號，它們在本書中代表某個對象或技術(shù)性名稱）?！　檢測電腦操作系統(tǒng)所使用的語言，并在菜單和對話框中用相應(yīng)的語言顯示。例如，如果使用中文Windows XP操作系統(tǒng)，則菜單和對話框都會以中文顯示。由于本書是用英文寫的，因此建議把語言設(shè)為英文，這樣計算機(jī)上顯示的所有信息就會與本書的一樣。在R圖標(biāo)的屬性選項“Shortcut”的“Target”中增加“Language=en”，注意在“Language”前加一個空格。

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