簡明生物信息學(xué)

前言

　　自20世紀以來，生物學(xué)與物理學(xué)、化學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域交叉滲透，相互融合，取得了長足的進步。隨著人類基因組計劃的實施和后基因組時代的到來，生物信息呈爆炸性增長之勢，信息科學(xué)及計算機技術(shù)在生命科學(xué)研究中開始發(fā)揮越來越重要的作用。一門新的交叉學(xué)科——生物信息學(xué)應(yīng)運而生。它應(yīng)用先進的數(shù)據(jù)管理技術(shù)、分析模型和計算軟件對各種生物信息（特別是分子生物學(xué)信息）進行提取、儲存、處理和分析，為探索復(fù)雜生命現(xiàn)象及其規(guī)律提供了有力的工具?！　∩镄畔W(xué)的發(fā)展迫切需要培養(yǎng)和造就新生力量。然而，目前國內(nèi)尚缺乏系統(tǒng)介紹該學(xué)科原理、方法與應(yīng)用的書籍。鐘揚教授等主編的《簡明生物信息學(xué)》一書非常及時，為廣大科技工作者和青年學(xué)生奉獻了一本很好的教材。該書內(nèi)容新穎，詳略得當(dāng)，既有必備的理論知識和基本原理，又有應(yīng)用性較強的實踐方法和操作步驟，尤其適合大學(xué)高年級學(xué)生和研究生學(xué)習(xí)。　　我衷心希望該書的出版能對我國生物信息學(xué)及相關(guān)學(xué)科的發(fā)展起到重要的推動作用。

內(nèi)容概要

物信息學(xué)是一門正在興起的交叉學(xué)科，已成為當(dāng)今生命科學(xué)和 自然科學(xué)的重大前沿領(lǐng)域之一。本 書概述了生物信息學(xué)的基本概念、必備的計算機基礎(chǔ)和主要的信息學(xué)資源，介紹了 DNA序列分析、系統(tǒng)發(fā)育分析、基因組分析以及蛋白質(zhì)組分析等分析方法、關(guān)鍵技術(shù)和常用軟件。除列有閱讀材料、參考文獻和思考題外，還附錄了生物信息學(xué)相關(guān)網(wǎng)址和刊物簡介。    本書由復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院和計算機科學(xué)系“生物多樣性信息學(xué)”聯(lián)合研究組集體編著。本書內(nèi)容新穎、簡明扼要、篇幅適當(dāng)，可作為生命科學(xué)和信息科學(xué)專業(yè)的高年級本科生、研究生教材。也可供其他專業(yè)師生和科研人員學(xué)習(xí)參考。

書籍目錄

第1章  緒論  1.1 生物信息學(xué)的產(chǎn)生與發(fā)展  1.2 生物信息學(xué)硒方法與前沿技術(shù)  1.3 生物信息學(xué)的應(yīng)用  1.4 生物信息學(xué)教育與學(xué)習(xí)  閱讀材料  參考文獻第2章  生物信息學(xué)的計算機基礎(chǔ)  2,1 數(shù)據(jù)管理與數(shù)據(jù)庫技術(shù)  2.2 計算機網(wǎng)絡(luò)與Internet  2.3 Internet上的高級信息管理  2.4 Java及移動計算  2.5 數(shù)據(jù)倉庫和數(shù)據(jù)挖掘  2.6 其他的計算機知識  思考題  閱讀材料  參考文獻第3章  生物信息學(xué)資源與數(shù)據(jù)挖掘工具  3.1 引言  3.2 生物信息學(xué)資源  3.3 分子數(shù)據(jù)挖掘工具  思考題  閱讀材料  參考文獻第4章  DNA序列分析  4.1 引言  4.2 表達序列標簽分析  4.3 序列對位排列  思考題  閱讀材料  參考文獻第5章  分子系統(tǒng)發(fā)育分析  5.1 分子進化的基本概念  5.2 分子進化模型與序列分歧度計算  5.3 分子系統(tǒng)樹的構(gòu)建  5.4 分子系統(tǒng)樹檢驗  5.5 分子系統(tǒng)發(fā)育分析軟件及應(yīng)用  思考題  閱讀材料  參考文獻第6章  基因組分析  6.1 引言  6.2 基因組分析原理  6.3 功能基因組學(xué)  6.4 比較基因組學(xué)  6.5 基因組分析系統(tǒng)實例——ACeDB  思考題  閱讀材料  參考文獻第7章  蛋白質(zhì)組分析  7.1 引言  7.2 蛋白質(zhì)組分析技術(shù)  思考題  閱讀材料  參考文獻附錄1 生物信息學(xué)相關(guān)網(wǎng)址附錄2 生物信息學(xué)相關(guān)刊物附錄3 英漢名詞索引附錄4 縮略詞表

編輯推薦

　　已知最小的自我復(fù)制生物——生殖道支原體（Mycoplasmagenitalium）基因組（468個基因）的注釋圖解（S．E．Brenner綜合自Frasier et at，Koonin et al，和0uzounis et at．的論文）。同色實心圓表示相同的注釋；不同色實心圓表示不同的注釋；黑色空心圓表示尚未注釋；彩色空心圓表示與SWISS-PROT數(shù)據(jù)庫中的注釋一致。

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