信息動力學(xué)與生物信息學(xué)

內(nèi)容概要

由胡剛等編著的《信息動力學(xué)與生物信息學(xué)：蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組的結(jié)構(gòu)分析》主要內(nèi)容由四部分組成第一部分是建立信息動力學(xué)的一般理論，說明其來源與意義，及其一般內(nèi)容與方法，由此形成其理論體系第二～四部分是對蛋白質(zhì)進行結(jié)構(gòu)分析，包括對蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與空間結(jié)構(gòu)的分析，空間結(jié)構(gòu)又分為三維結(jié)構(gòu)與空間形態(tài)結(jié)構(gòu)兩部分內(nèi)容，其中涉及一系列的信息動力學(xué)問題與其他多種不同類型的數(shù)學(xué)問題，也與生物、醫(yī)學(xué)與醫(yī)藥衛(wèi)生中的一些重要問題密切相關(guān)附錄是對物理、化學(xué)與生物學(xué)中的一些基本知識的介紹，可供不同專業(yè)的讀者參考，也為《信息動力學(xué)與生物信息學(xué)：蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組的結(jié)構(gòu)分析》其他各章所直接引用。
《信息動力學(xué)與生物信息學(xué)：蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組的結(jié)構(gòu)分析》涉及大量生物信息數(shù)據(jù)庫的計算，許多計算結(jié)果與彩色圖像無法在正文中給出，因此附有光盤一張，作為正文的補充與說明。
《信息動力學(xué)與生物信息學(xué)：蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組的結(jié)構(gòu)分析》可供數(shù)學(xué)、生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、計算機科學(xué)等專業(yè)的高年級本科生、研究生、教師和科研工作者閱讀參考。

書籍目錄

前言
第1章　概論
　1.1　常用符號
　　1.1.1　英文大、小寫字母與希臘字母的表示
　　1.1.2　數(shù)學(xué)函數(shù)公式與符號的表示
　　1.1.3　一些重要的單位符號
　1.2　主要內(nèi)容與結(jié)果
　　1.2.1　ID的理論要點
　　1.2.2　蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的語義分析
　　1.2.3　蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的ID分析
　　1.2.4　蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的動力學(xué)問題
　　1.2.5　蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)研究
　　1.2.6　蛋白質(zhì)空間形態(tài)的研究
　1.3　其他問題的說明
　　1.3.1　關(guān)于數(shù)據(jù)庫與數(shù)據(jù)處理中的一些問題
　　1.3.2　對本書附帶光盤的說明
第一部分　基本原理與方法
第2章　ID與生物信息學(xué)
　2.1　ID概述
　　2.1.1　ID的目的與意義
　　2.1.2　ID與物理學(xué)
　　2.1.3　ID的主要研究方法
　　2.1.4　ID所存在的問題與注意事項
　2.2　生物信息學(xué)簡介
　　2.2.1　生物信息學(xué)的研究目標(biāo)與特征
　　2.2.2　生物信息學(xué)的范疇與內(nèi)容
　　2.2.3　后基因組研究中的一些問題
　2.3　對光盤的說明
　　2.3.1　數(shù)據(jù)庫的選擇與預(yù)處理
　　2.3.2　對光盤中文件的說明
　　2.3.3　光盤閱讀的注意事項
第3章　ID的基本原理與方法
　3.1　ID的研究對象與數(shù)據(jù)庫的類型與要素
　　3.1.1　數(shù)據(jù)庫的類型與結(jié)構(gòu)特征
　　3.1.2　數(shù)據(jù)庫的基本要素
　　3.1.3　人類自然語言文字與生物信息語言的比較
　3.2　信息統(tǒng)計分析法
　　3.2.1　IDF的一般定義與性質(zhì)
　　3.2.2　三種特殊類型的IDF
　　3.2.3　由交互信息與條件概率產(chǎn)生的IDF
　　3.2.4　IDF的若干性質(zhì)
　　3.2.5　局部詞與局部詞詞庫
　3.3　組合分析法與圖論的概述
　　3.3.1　組合分析法的目的、內(nèi)容與意義
　　3.3.2　有關(guān)圖與樹的基本知識
　3.4　數(shù)據(jù)庫的核心詞與核心詞詞庫
　　3.4.1　有關(guān)數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)的記號與說明
　　3.4.2　核心詞的定義與性質(zhì)
　　3.4.3　核心詞詞庫遞推計算法
第4章　語義分析概論
　4.1　詞與詞法分析要點
　　4.1.1　詞庫的詞法與句法分析的幾個基本概念
　　4.1.2　有關(guān)詞法分析的一些定義、記號與模型
　　4.1.3　詞庫中詞的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)關(guān)系
　　4.1.4　有關(guān)極小樹網(wǎng)圖結(jié)構(gòu)的一些定義
　　4.1.5　核心詞的詞法分析
　4.2　詞與句的結(jié)構(gòu)關(guān)系與同源蛋白質(zhì)組的類型分析
　　4.2.1　詞與句的關(guān)系數(shù)據(jù)庫
　　4.2.2　由關(guān)系數(shù)據(jù)庫作有關(guān)語法問題的討論
　　4.2.3　網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中的布爾代數(shù)
　4.3　句或蛋白質(zhì)的信息動力函數(shù)（SIDF或PIDF）
　　4.3.1　引進PIDF的基本思想及其定義
　　4.3.2　PIDF的隨機分析概述
　　4.3.3　PIDF的運動及其他類型的分析
　　……
第二部分　蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)研究中的ID方法
第三部分　蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)分析
第四部分　蛋白質(zhì)的空間形態(tài)
參考文獻
索引

章節(jié)摘錄

版權(quán)頁：插圖：第1章 概論為使讀者對本書內(nèi)容與結(jié)果的全貌有一初步了解，本章先對有關(guān)方面作一說明，其中包括對一些常用符號的說明。1.1常用符號由于本書的內(nèi)容涉及多學(xué)科領(lǐng)域（數(shù)學(xué)、生物學(xué)與計算機科學(xué)，也與物理、化學(xué)中的一些問題有關(guān)），在不同學(xué)科中所采用的記號與名稱往往不同，所以有必要先對它們作統(tǒng)一的表達與說明，盡量使這些定義與記號與原學(xué)科的表達保持一致。1.1.1英文大、小寫字母與希臘字母的表示在本書中，除了不同學(xué)科，即使在同一學(xué)科中，同一變量也會有不同的表達方式，同一符號也可表示不同的變量，因此務(wù)請讀者注意有關(guān)符號的定義與說明，注意其中的內(nèi)在含義與區(qū)別。1.英文大寫字母的表示在本書中，英文大寫字母有4種不同的表達方式，分大寫斜體、正體、黑體與花體，它們在不同的場合使用。（1）英文大寫斜體字母，如A，B，C，D，X，Y，Z等表示集合、向量或空間中的點的一般記號。幾個英文大寫斜體字母的連寫有其特殊含義，如AB為線段。AB為有向線段或向量，jAB|為線段長度，R為實數(shù)空間等。（2）英文大寫正體字母，如A，R，N，D等表示氨基酸一字符，C，N，O，S等為原子記號。幾個英文大寫正體字母的連寫有其特殊含義，后面還會做特別的說明。（3）英文大寫黑體字母，如A，B，C，D等表示矩陣。有時也表示向量的集合或集合的集合，如Z=fZ1；Z2}表示由兩個向量（或集合）Z1；Z2所組成的集合。（4）英文大寫花體字母，如A，B，P，V等表示集合的集合、數(shù)據(jù)庫或參數(shù)系，一般表示由本書所設(shè)計產(chǎn)生的特殊類型的數(shù)據(jù)庫。另外較為常用的記號如E表示坐標(biāo)系，P表示某種類型的參數(shù)系，Z，Z0，Z+分別表示全體整數(shù)、全體非負整數(shù)與全體正整數(shù)。2.英文小寫字母的表示英文小寫字母的類型也分小寫斜體、正體、黑體三種，它們在不同的場合使用。（1）英文小寫斜體字母，如a，b，c，d，x，y，z等表示數(shù)字，或集合、向量、矩陣中的元，或空間中的點（空間中的點可用英文大寫斜體字母表示，也可用英文小寫斜體字母表示）。（2）英文小寫正體字母，如a，c，g，t，u表示核苷酸。（3）英文小寫黑體字母，如a，b，c，d，x，y，z等表示向量。3.英文字母的連寫與修飾英文字母的各種不同類型字體都存在連寫與修飾的問題，包括上、下標(biāo)的修飾，與其他數(shù)學(xué)符號的修飾等，如（1）英文字母+右下標(biāo)表示該字母排列的次序，如（a1；a2；a3）表示該向量中的三個分量，Vq=f1，2，；q}或Vq=f0，1，；q。1}是一種特殊的q元集合記號。

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《信息動力學(xué)與生物信息學(xué):蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)組的結(jié)構(gòu)分析》是數(shù)學(xué)與現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)叢書之一。

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