免疫信息學

前言

　　本書闡述的是免疫信息學相關(guān)內(nèi)容及其在免疫原性預(yù)測中日益重要的作用。所謂免疫原性，即當病原體暴露于免疫系統(tǒng)監(jiān)視下時，誘導特異性免疫應(yīng)答的能力。免疫信息學是將基于計算機科學的信息技術(shù)應(yīng)用于免疫系統(tǒng)中分子之間相互作用的一門學科，近年來，免疫信息學在科學前沿領(lǐng)域和實際應(yīng)用方面的發(fā)展為世人矚目，除用于免疫原性的預(yù)測之外，還可參與解決免疫學的幾乎所有問題。盡管許多人對免疫信息學在疫苗發(fā)現(xiàn)和研究中的實際應(yīng)用尚存疑問，但能理解并充分利用其潛能的人已將該方法視為一種重要工具?！睹庖咝畔W——計算機輔助預(yù)測免疫原性》一書是渴望緊跟此新興技術(shù)者的入門讀物。本書并不打算無所不包，而是重點關(guān)注免疫信息學中的重要領(lǐng)域，試圖讓讀者對免疫信息學的地位及其發(fā)展趨勢有所了解。我們希望本書不僅能吸引讀者，而且可為免疫信息學在免疫學和疫苗學中的應(yīng)用提供深厚的背景知識。由于系統(tǒng)生物學正高速發(fā)展并影響著其他領(lǐng)域，毫無疑問，生物科學包括免疫學的未來必然屬于那些有能力將生物科學的實驗和理論緊密結(jié)合的人，因為他們能一直輕松地將實驗技術(shù)和計算科學相結(jié)合。作為一門交叉學科，免疫信息學要取得支配地位尚需時日，但這天終將到來，正如那些身穿白大褂、只知道手持吸液管反對自動化的勒德分子（Luddite）和只會傻瞪著電腦屏幕的笨拙的人最后都將被時代拋棄?？茖W研究作為一個整體，應(yīng)當盡可能全身心地接受免疫信息學帶來的變化。相信假以時日，人們對免疫信息學的懷疑和排斥就將消除，因此，翻開《免疫信息學——計算機輔助預(yù)測免疫原性》這本書吧，獲取其中的智慧，品味其中的精華，收集深刻的見解，同時忘記其中諸多的瑕疵、矛盾、缺點及遺漏，銘記最重要的是從中學習并盡量享受學習的樂趣。

內(nèi)容概要

隨著基因組學、計算機技術(shù)以及免疫學的快速發(fā)展，免疫信息學已經(jīng)成為一個新興的且逐步完善的研究領(lǐng)域。免疫信息學分析就是利用免疫學的規(guī)律，對免疫學實驗結(jié)果進行預(yù)測，再通過有效的免疫學實驗進行驗證，從而大幅度地減少免疫學研究的工作量，節(jié)約研究成本，促進現(xiàn)代免疫學的發(fā)展。本書系統(tǒng)介紹了免疫信息學的概念、產(chǎn)生和發(fā)展、相關(guān)數(shù)據(jù)庫、研究方法及其應(yīng)用等，特別著重于抗原性的預(yù)測、分析和計算機輔助疫苗設(shè)計，并介紹了一些復(fù)雜軟件的使用方法，因此理論性和實用性都很強?！　”緯ㄎ挥诿庖咝畔W初學者，尤其適合本科生、研究生，對于免疫學研究工作者也有很大的參考價值。

書籍目錄

譯者序 前言 　1 免疫信息學與計算機輔助預(yù)測免疫原性：導論 第1部分 數(shù)據(jù)庫 　2 國際免疫遺傳學信息系統(tǒng)(1MGT) 　3 IMGT／HLA數(shù)據(jù)庫 　4 免疫多態(tài)性數(shù)據(jù)庫：IPD 　5 T細胞表位查詢和預(yù)測數(shù)據(jù)庫：SYFPEITHI 　6 T細胞表位、MHC結(jié)合肽和TAP結(jié)合肽的搜尋及描圖 　7 Bcipep數(shù)據(jù)庫中B細胞表位的搜尋及描圖 　8 半抗原、載體蛋白和抗半抗原抗體的檢索 第2部分 HLA超型鑒定 　9 基于GRID／CPCA和層次聚類法的HLA超型分類 　10 HLA-A2超型的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ) 　11 基于MHC結(jié)合肽庫定義MHC超型 　12 基于肽結(jié)合凹槽靜電分布圖的HLA-I類等位基因分型 第3部分 肽與MHC結(jié)合能力的預(yù)測 　13 特征參數(shù)法預(yù)測MHC結(jié)合肽 　14 機器學習技術(shù)預(yù)測MHC結(jié)合肽 　15 人工智能方法預(yù)測T細胞表位 　16 小鼠MHC-多肽親和力的預(yù)測 　17 3D-QSAR模型預(yù)測MHC-多肽親和力 　18 基于MHC分子模型預(yù)測表位肽 　19 基于支持向量機預(yù)測MHC結(jié)合肽 　20 應(yīng)用SVRMHC方法預(yù)測多肽與MHC分子的結(jié)合親和力 　21 基于結(jié)構(gòu)及分子模擬預(yù)測HLA結(jié)合肽 　22 基于結(jié)構(gòu)預(yù)測MHC結(jié)合肽操作指南 　23 MHC-I及MHC-II與肽結(jié)合的靜態(tài)能分析 　24 分子動力學模擬 　25 一種預(yù)測MHC-II類分子結(jié)合肽的迭代方法 　26 MHC-II類分子結(jié)合肽綜合預(yù)測方法 　27 基于貝葉斯神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的MHC-II類分子-肽復(fù)合物非線性預(yù)測模型 第4部分 免疫系統(tǒng)其他特性的預(yù)測 　28 TAPPred法預(yù)測抗原中的TAP結(jié)合肽 　29 B細胞表位的預(yù)測方法 　30 一種MHC分子結(jié)構(gòu)功官皂相似性分析平臺：HistoCheck 　31 免疫相關(guān)性毒力因子的預(yù)測 索引 彩圖

章節(jié)摘錄

　　關(guān)于免疫原性的許多問題依然存在：導致免疫原性的內(nèi)在分子機制是什么？對于細胞免疫，表位免疫原性是由多肽和MHC結(jié)合的半衰期（解離率）決定，還是由MI-{C一多肽結(jié)合親和力決定？與抗原提呈細胞表面的MHC多肽數(shù)量有關(guān)，還是由形成的免疫突觸的持續(xù)作用決定？需要強調(diào)的是，免疫原性并不是單由肽與MHC分子的結(jié)合發(fā)揮功能，而是由機體識別的一系列信號構(gòu)成，多肽只是其中之一。肽的結(jié)合是必要的，但并不是唯一的?！　∫欢螘r間以來，數(shù)據(jù)庫成了生物信息學的通用語言.雖然生物相關(guān)信息的數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)類型可能改變，但是數(shù)據(jù)庫的使用、構(gòu)建和操作都反映了生物信息學的同一特征，免疫信息學的數(shù)據(jù)庫也具有同樣的特征，這些在其對后基因組生物科學的支持可以得到證實。21世紀，免疫學進入信息經(jīng)濟時代，數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)得以廣泛傳播。以上所述，雖然對免疫學數(shù)據(jù)庫沒有特別新的東西，但是免疫信息學的深入發(fā)展顯示了生物信息學在免疫學中的應(yīng)用開始擴展和成熟?！　±?，IMGT數(shù)據(jù)庫（將在第2-4章描述）已關(guān)注免疫重要相關(guān)大分子的序列分析很多年了。定位于表位功能或者以記錄表位MHC分子親和力為主的數(shù)據(jù)庫相對較新，但也已初具規(guī)模。

圖書封面

評論、評分、閱讀與下載

---

    免疫信息學 PDF格式下載

---