生態(tài)基因組學(xué)導(dǎo)論

內(nèi)容概要

本書介紹了一個(gè)非常前沿的領(lǐng)域一生態(tài)基因組學(xué)。這門學(xué)科將基因組學(xué)的研究手段和方法引入生態(tài)學(xué)領(lǐng)域，從基因組學(xué)的角度考察了三個(gè)生態(tài)學(xué)的基本問題：生態(tài)系統(tǒng)中群落的結(jié)構(gòu)和功能、不同的生活史類型和變異以及生態(tài)位的界定。    雖然其內(nèi)容主要來源于零散的第一手研究論文，但在作者的精心組織下，本書的前沿性和系統(tǒng)性得到了統(tǒng)一，適合作為本科生和研究生的參考用書。對(duì)生態(tài)學(xué)研究感興趣的讀者可以學(xué)習(xí)如何應(yīng)用基因組學(xué)的技術(shù)深化生態(tài)學(xué)的研究；對(duì)其他學(xué)科(如分子生物學(xué))有興趣的讀者可以學(xué)習(xí)生態(tài)學(xué)的基本概念和基礎(chǔ)知識(shí)，以及如何將基因組學(xué)和生態(tài)學(xué)相結(jié)合，從而形成這門新的前沿交叉學(xué)科。

書籍目錄

1 什么是生態(tài)基因組學(xué)？  1.1 滲透到生態(tài)學(xué)領(lǐng)域的基因組學(xué)革命  1.2 酵母、果蠅、線蟲和擬南芥  1.3 組學(xué)  1.4 本書的結(jié)構(gòu)2 基因組分析  2.1 基因的發(fā)現(xiàn)    2.1.1 從基因產(chǎn)物到基因    2.1.2 差異篩選    2.1.3 從分子標(biāo)記到功能基因  2.2 基因組測(cè)序    2.2.1 基因組文庫(kù)的構(gòu)建    2.2.2  以物理圖譜為基礎(chǔ)的全基因組測(cè)序    2.2.3 “鳥槍法”全基因組測(cè)序    2.2.4 基因的預(yù)測(cè)和注釋  2.3 轉(zhuǎn)錄譜分析    2.3.1 芯片分析    2.3.2 生態(tài)基因組學(xué)中以芯片為基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)錄譜分析    2.3.3 基因表達(dá)系列分析    2.3.4 定量PCR分析  2.4 生態(tài)基因組學(xué)中的數(shù)據(jù)分析    2.4.1 序列的同源性分析    2.4.2 芯片數(shù)據(jù)的處理    2.4.3 芯片實(shí)驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)方法    2.4.4 構(gòu)建生態(tài)基因組學(xué)的分析框架3 基因組的比較  3.1 基因組的特征    3.1.1 基因組大小    3.1.2 基因家族    3.1.3 偏斜、Gc含量和密碼子的使用    3.1.4 基因的排列    3.1.5 同義和非同義替換的式樣’  3.2 原核生物的基因組    3.2.1 染色體和質(zhì)粒    3.2.2 基因的水平轉(zhuǎn)移    3.2.3 從細(xì)菌到細(xì)胞器  3.3 真核生物的基因組    3.3.1  酵母和其他真菌    3.3.2 線蟲    3.3.3 果蠅和其他節(jié)肢動(dòng)物    3.3.4 植物基因組    3.3.5 后口動(dòng)物4 群落的結(jié)構(gòu)和功能  4.1 生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)功能的綜合模式  4.2 微生物多樣性的測(cè)度    4.2.1 小亞基rRNA基因的多樣性    4.2.2 以基因芯片技術(shù)為基礎(chǔ)的生物多樣性評(píng)估    4.2.3 原核生物多樣性的統(tǒng)計(jì)方法  4.3 生物地球化學(xué)循環(huán)中的微生物基因組學(xué)    4.3.1 碳循環(huán)中的關(guān)鍵基因    4.3.2 氮循環(huán)中的關(guān)鍵基因    4.3.3 其他的養(yǎng)分循環(huán)    4.3.4 利用基因芯片技術(shù)篩選功能基因  4.4 環(huán)境基因組的功能重建    4.4.1 海洋環(huán)境基因組學(xué)    4.4.2 土壤環(huán)境基因組    4.4.3 極端環(huán)境的基因組  4.5 生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)功能的基因組學(xué)研究方法：初步評(píng)估5 生活史類型  5.1 生活史理論的核心  5.2 壽命與衰老    5.2.1 胰島素信號(hào)途徑    5.2.2 壽命調(diào)節(jié)的全基因組掃描分析    5.2.3 跨物種的壽命調(diào)節(jié)系統(tǒng)    5.2.4 權(quán)衡還是單獨(dú)調(diào)節(jié)？  5.3 生命周期循環(huán)的基因表達(dá)譜    5.3.1 發(fā)育進(jìn)程    5.3.2 滯育    5.3.3 成熟期的生命和性    5.3.4 擬南芥的開花時(shí)間    5.3.5 其他植物開花時(shí)間的調(diào)控  5.4 生活史特征的表型可塑性    5.4.1 非遺傳多型性的發(fā)育    5.4.2 體長(zhǎng)    5.4.3 避陰反應(yīng)    5.5 生活史類型的基因組學(xué)研究方法：初步評(píng)估6 逆境反應(yīng)7 整合生態(tài)基因組學(xué)參考文獻(xiàn)附錄：原版目錄索引

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