出版時間:2005-4 出版社:科學(xué)出版社 作者:伍欣星 頁數(shù):254
內(nèi)容概要
《生物信息學(xué):基礎(chǔ)與臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用指南》較為詳盡地介紹了生物信息學(xué)在醫(yī)學(xué)科研和臨床應(yīng)用中的最新信息及資料。全書分為上下兩篇,共十四章,通過大量的實(shí)例,系統(tǒng)介紹了生物信息學(xué)的一些基本知識,以及生物信息學(xué)在功能基因組學(xué)研究中的應(yīng)用,這些內(nèi)容對于醫(yī)學(xué)科研的設(shè)計和實(shí)施將極具指導(dǎo)意義?! 渡镄畔W(xué):基礎(chǔ)與臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用指南》對分子生物學(xué)以及信息學(xué)的一些名詞給出了中英文對照和必要的解釋,列出了一些常用的生物信息相關(guān)網(wǎng)站,更加方便了讀者的使用?! 渡镄畔W(xué):基礎(chǔ)與臨床醫(yī)學(xué)應(yīng)用指南》既可作為生物信息學(xué)課程的教材,也是一本實(shí)用性很強(qiáng)的生物信息學(xué)參考書。
書籍目錄
上篇 生物信息學(xué)基礎(chǔ)第一章 生物信息學(xué)概述1.1 生物信息學(xué)的定義和研究范疇1.1.1 生物信息學(xué)的定義1.1.2 生物信息學(xué)中的數(shù)據(jù)庫與網(wǎng)絡(luò)1.1.3 生物信息學(xué)的主要研究范疇1.2 生物信息學(xué)的建立與發(fā)展1.3 醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)的發(fā)展與展望1.3.1 醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)的主要研究內(nèi)容1.3.2 生物信息學(xué)的發(fā)展和展望第二章 醫(yī)學(xué)生物信息數(shù)據(jù)庫2.1 醫(yī)學(xué)生物信息數(shù)據(jù)庫簡介2.2 國外常用醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫2.2.1 pubmed文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫2.2.2 highwire press電子期刊數(shù)據(jù)庫2.3 國內(nèi)常用生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索數(shù)據(jù)庫2.3.1 萬方數(shù)據(jù)資源系統(tǒng)2.3.2 中國期刊網(wǎng)第三章 核酸數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用3.1 常用的dna數(shù)據(jù)庫及軟件3.1.1 genbank--ncbi核酸序列數(shù)據(jù)庫3.1.2 embl--歐洲核酸序列數(shù)據(jù)庫3.1.3 ddbj--日本dna數(shù)據(jù)庫3.2 常用的rna數(shù)據(jù)庫及軟件3.2.1 transterm--mrna序列和翻譯調(diào)控元件數(shù)據(jù)庫3.2.2 rdp-ii--核糖體數(shù)據(jù)庫3.2.3 rna二級結(jié)構(gòu)預(yù)測3.3 核酸同源性序列比對的策略和方法3.3.1 數(shù)據(jù)庫中的相似性搜索3.3.2 blast簡介3.3.3 blast應(yīng)用舉例3.4 新序列的提交第四章 人類基因組變異數(shù)據(jù)庫4.1 snp數(shù)據(jù)庫4.1.1 dbsnp數(shù)據(jù)庫4.1.2 人類基因組變異數(shù)據(jù)庫4.2 突變數(shù)據(jù)庫4.3 基因標(biāo)記物與微衛(wèi)星數(shù)據(jù)庫4.4 觀察snp和突變的工具4.4.1 在基因組水平上觀察snp和突變的工具4.4.2 在基因水平上觀察snp和突變的工具第五章 蛋白質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫5.1 swiss-port蛋白序列數(shù)據(jù)庫5.1.1 swiss-port蛋白序列數(shù)據(jù)庫區(qū)別于其他蛋白序列數(shù)據(jù)庫的優(yōu)點(diǎn)5.1.2 swiss-prot數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)與級別5.1.3 序列條目的結(jié)構(gòu)5.1.4 不同的行類型5.1.5 數(shù)據(jù)庫的檢索5.2 astral--蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和序列分析體系第六章 生物芯片6.1 概述6.1.1 生物芯片簡介6.1.2 生物芯片分類6.1.3 幾種常見的生物芯片6.2 基因芯片基本原理和基本流程6.2.1 基因芯片的基本原理6.2.2 基因芯片的基本流程6.3 幾種新型的芯片技術(shù)6.4 生物芯片的應(yīng)用6.5 生物信息學(xué)中的新技術(shù)附 基因芯片進(jìn)行基因差異表達(dá)實(shí)際操作舉例第七章 疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫7.1 綜合臨床數(shù)據(jù)庫7.2 腫瘤相關(guān)數(shù)據(jù)庫7.2.1 cancer.gov--腫瘤網(wǎng)7.2.2 oncolink7.2.3 癌癥基因組剖析計劃(cgap)7.2.4 中國癌癥網(wǎng)7.3 心血管疾病相關(guān)數(shù)據(jù)庫7.3.1 心血管疾病相關(guān)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(cardio)7.3.2 中華心血管醫(yī)學(xué)網(wǎng)7.4 遺傳性疾病數(shù)據(jù)庫7.5 感染性疾病數(shù)據(jù)庫第八章 生物信息學(xué)與藥物設(shè)計8.1 概述8.2 生物信息學(xué)在藥物設(shè)計中的優(yōu)勢8.3 生物信息學(xué)在藥物設(shè)計環(huán)節(jié)中的應(yīng)用8.3.1 初始階段:事半功倍的效果8.3.2 生物活性篩選階段:提高篩選命中率8.3.3 藥物開發(fā)階段:聯(lián)系遺傳信息與藥物療效的橋梁8.4 藥物設(shè)計過程中生物信息學(xué)應(yīng)用流程8.4.1 綜合分子生物學(xué)方法8.4.2 est數(shù)據(jù)庫搜尋8.4.3 結(jié)構(gòu)生物學(xué)方法8.5 生物信息學(xué)在藥物設(shè)計中的其他應(yīng)用8.5.1 藥物作用的機(jī)制8.5.2 藥物的藥代動力學(xué)及毒理性質(zhì)的研究8.5.3 計算機(jī)輔助藥物設(shè)計8.6 后基因組時代藥物研究的新進(jìn)展和新趨勢附 藥物設(shè)計實(shí)例第九章 常用軟件介紹9.1 omiga介紹9.2 antheprot介紹9.3 macaw介紹9.4 primer premier介紹9.5 reference manager介紹9.6 常用限制酶分析與質(zhì)粒作圖軟件9.6.1 gene construction kit 2.59.6.2 clone manager 79.7 rna二級結(jié)構(gòu)預(yù)測及分析軟件9.7.1 rnadraw 1.1b9.7.2 rna structure 3.29.8 序列綜合分析軟件第十章 基因芯片微陣列數(shù)據(jù)分析10.1 常用基因芯片及其數(shù)據(jù)簡介10.2 基因芯片數(shù)據(jù)處理與分析10.3 基因芯片數(shù)據(jù)分析的基本策略與方法10.4 基因微陣列數(shù)據(jù)分析中的常用軟件10.4.1 excel10.4.2 sam10.4.3 r及其在基因表達(dá)數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用下篇 生物信息學(xué)與功能基因組學(xué)互動平臺第十一章 生物信息學(xué)與基因組學(xué)技術(shù)11.1 新基因分析的生物信息學(xué)策略11.2 新基因的分離——cdna末端快速擴(kuò)增技術(shù)11.3 基因突變檢測(分析)技術(shù)11.4 mrna差異顯示技術(shù)11.5 比較基因組雜交技術(shù)11.6 微陣列-比較基因組雜交技術(shù)11.7 基因表達(dá)分析技術(shù)11.8 snps、ests在研究新(未知)基因中的應(yīng)用第十二章 rna組學(xué)及常用研究技術(shù)12.1 反義核酸技術(shù)12.2 核酶技術(shù)12.3 rna錯折疊技術(shù)12.4 rna干擾技術(shù)第十三章 模式生物體研究13.1 轉(zhuǎn)基因動物13.1.1 轉(zhuǎn)基因動物概念13.1.2 基本原理13.1.3 嵌合體動物13.1.4 轉(zhuǎn)基因動物模型在醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用13.2 基因打靶技術(shù)13.2.1 基因打靶技術(shù)的原理13.2.2 基因打靶的操作要點(diǎn)13.2.3 提高基因打靶效率的途徑13.2.4 基因打靶技術(shù)的應(yīng)用13.3 時空可調(diào)節(jié)性基因打靶技術(shù)與基因陷阱13.3.1 時空可調(diào)節(jié)性基因打靶13.3.2 基因陷阱13.3.3 誘變技術(shù)在功能基因組學(xué)中的應(yīng)用第十四章 蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)14.1 蛋白質(zhì)組分離技術(shù)14.1.1 二維聚丙烯酰胺凝膠電泳14.1.2 高效液相色譜(hplc)14.1.3 毛細(xì)管電泳及電色譜(ce/cec)14.2 鑒定技術(shù)14.2.1 質(zhì)譜技術(shù)14.2.2 圖像分析技術(shù)14..2.3 高流通量篩選(hts)14.3 蛋白質(zhì)芯片技術(shù)14.4 酵母雙雜交系統(tǒng)附錄 生物信息學(xué)及分子生物學(xué)術(shù)語
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