計算分子生物學(xué)導(dǎo)論

內(nèi)容概要

分子生物學(xué)的迅速發(fā)展，產(chǎn)生了大量的數(shù)據(jù)，而其間的關(guān)系也日趨復(fù)雜。計算分子生物學(xué)就是處理這些數(shù)據(jù)的新科學(xué)。    本書主要是介紹分子生物學(xué)中具有代表性的計算問題以及某些求解這些問題的有效方法。具體包括：分子生物學(xué)的基本概念；兩個重要的數(shù)學(xué)對象，即串和圖，和算法的基本概念等；序列比較和經(jīng)典的動態(tài)程序設(shè)計算法；DNA片段組裝技術(shù)；DNA的物理作圖問題和一種物理作圖的近似算法及啟發(fā)式；與種系發(fā)生樹構(gòu)造有關(guān)的一些數(shù)學(xué)問題和某些由于構(gòu)造特定類型種系發(fā)生樹的算法；用以研究DNA中序列差異的數(shù)學(xué)模型和用于RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測的動態(tài)程序設(shè)計法以及蛋白質(zhì)比配方法；最后還介紹了DNA計算。    本書可供研究基因組學(xué)與分子生物學(xué)的生物學(xué)、數(shù)學(xué)、計算機(jī)科學(xué)等專業(yè)的科研人員、教師、研究生等參考。

作者簡介

巴西

書籍目錄

譯者序前言　全書概述　習(xí)題　錯誤　致謝第一章 分子生物學(xué)的基本概念　1.1 生命　1.2 蛋白質(zhì)　1.3 核酸　1.4 分子遺傳學(xué)機(jī)制　1.5 基因組是如何被研究的　1.6 人類基因組計劃　1.7 序列數(shù)據(jù)庫　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第二章 串、圖和算法　2.1 串　2.2 圖　2.3 算法　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第三章 序列比較與數(shù)據(jù)庫搜索　3.1 生物學(xué)背景　3.2 比較兩個序列　3.3 基本算法的擴(kuò)展 　3.4 比較多個序列　3.5 數(shù)據(jù)庫搜索　3.6 其他問題　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第四章 DNA片段組裝　4.1 生物學(xué)背景　4.2 模型　4.3 算法　4.4 啟發(fā)式　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第五章 DNA物理作圖　5.1 生物學(xué)背景　5.2 模型　5.3 一個CIP問題的算法　5.4 帶錯雜交作圖的一種近似　5.5 雜交作圖的啟發(fā)式　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第六章 種系發(fā)生樹　6.1 性狀狀態(tài)和完全種系發(fā)生問題　6.2 二值性狀狀態(tài)　6.3 兩個性狀　6.4 種系樹的簡約性和相容性　6.5 距離矩陣算法　6.6 種系數(shù)之間的一致　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第七章 基因組重排　7.1 生物學(xué)背景　7.2 有向塊　7.3 無向塊　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第八章 分子結(jié)構(gòu)預(yù)測　8.1 RNA二級結(jié)構(gòu)預(yù)測　8.2 蛋白質(zhì)折疊問題　8.3 蛋白質(zhì)比配　小結(jié)　習(xí)題　文獻(xiàn)提要第九章 結(jié)語：DNA計算　9.1 曼哈頓通路問題　9.2 可滿足性　9.3 問題與展望　習(xí)題　文獻(xiàn)提要習(xí)題選解參考文獻(xiàn)索引

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